IS-IS報文有以下幾種類型：HELLO PDU、LSP和SNP。
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Hello PDU
Hello報文用於建立和維持鄰居關系，也稱為IIH（IS-to-IS Hello PDUs）。其中，廣播網中的Level-1 IS-IS使用Level-1 LAN IIH；廣播網中的Level-2 IS-IS使用Level-2 LAN IIH；非廣播網絡中則使用P2P IIH。它們的報文格式有所不同。
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LSP
鏈路狀態報文LSP（Link State PDUs）用於交換鏈路狀態信息。LSP分為兩種：Level-1 LSP和Level-2 LSP。Level-1 LSP由Level-1 IS-IS傳送，Level-2 LSP由Level-2 IS-IS傳送，Level-1-2 IS-IS則可傳送以上兩種LSP。-
LSP報文中主要字段的解釋如下：
ATT字段：當Level-1-2 IS-IS在Level-1區域內傳送Level-1 LSP時，如果Level-1 LSP中設置了ATT位，則表示該區域中的Level-1 IS-IS可以通過此Level-1-2 IS-IS通往外部區域。OL（LSDB Overload）字段：過載標志位。
設置了過載標志位的LSP雖然還會在網絡中擴散，但是在計算通過過載路由器的路由時不會被采用。即對路由器設置過載位后，其它路由器在進行SPF計算時不會使用這台路由器做轉發，只計算該節點上的直連路由。
IS Type字段：用來指明生成此LSP的IS-IS類型是Level-1還是Level-2 IS-IS（01表示Level-1，11表示Level-2）。
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SNP
序列號報文SNP（Sequence Number PDUs）通過描述全部或部分數據庫中的LSP來同步各LSDB（Link-State DataBase），從而維護LSDB的完整與同步。SNP包括全序列號報文CSNP（Complete SNP）和部分序列號報文PSNP（Partial SNP），進一步又可分為Level-1 CSNP、Level-2 CSNP、Level-1 PSNP和Level-2 PSNP。
CSNP包括LSDB中所有LSP的摘要信息，從而可以在相鄰路由器間保持LSDB的同步。在廣播網絡上，
CSNP由DIS定期發送（缺省的發送周期為10秒）；在點到點鏈路上，CSNP只在第一次建立鄰接關系時發送。PSNP只列舉最近收到的一個或多個LSP的序號，它能夠一次對多個LSP進行確認，當發現LSDB不同步時，也用PSNP來請求鄰居發送新的LSP。
IS-IS報文中的變長字段部分是多個TLV（Type-Length-Value）三元組。不同PDU類型所包含的TLV是不同的。