產生的一系列文件中:
https://www.bilibili.com/video/BV1U5411s7kg?p=3 嚴老師視頻
(1)頭動矯正 其中FD_Jenkinson最好

下面這個是很早以前用來排除被試的,現在不用了,現在都用meanFD排除

HeadMotion.tsv: 顯示最大或平均頭動,mean FD,...一般使用 mean FD后面做統計分析
(2)Reonent Fun和Reonent T1用於質量控制,調整位置到前聯合(空間的原點) 自己可以打分


(3)AutoMask
有的被試被掃的面積沒有覆蓋到全腦,用來檢驗蓋住的多少,
(4)T1 DICOM to NIFTI:
dicom的結構像轉成nifti
(5)Bet: 結構像和功能像配准之前去除頭皮干擾

具體步驟:先bet去除頭皮干擾,然后結構像去配准功能像,后再應用到之前未去頭皮的結構像,再去segment分割(帶着頭皮分割效果好,bet也有可能損傷)

(6)T1 Coreg Fun:結構像配到功能像空間
(7)segment:把大腦的結構像分割成灰質、白質和腦脊液,是老的segment不用
用new segment+DARTEL: 36min
segment生成的結果:

(8)Nuisance Covariates Regression:去除噪聲
Polynomial trend:1 去除線性漂移
Head Motion model: 用Friston 24 做頭動矯正
。。。
(9)Normalize 空間配准
意義:將很多被試者的大腦配到一個標准的模板上面,才能對相同的東西進行比較,如pcc
方法:1.EPI模板 2.T1先對T1分割成白質灰質腦脊液,再用到功能圖像上去 3.DARTEL:用的最多
45min DARTEL:基於分割結果,基於100個被試的group ,,再把這個模板配到MNI空間 費時。。
smooth:提高配准效果 注:計算reho、degree前不要用smooth!
Default mask:基於腦內的體素進行
至此,所有的預處理步驟選擇完畢!!! (只進行預處理的話,下面所有的一切全都不用選了)
數據分析:
