用了一下beast，一步一步的，感覺有點麻煩（用慣了linux，點點點的感覺較為復雜）。
於是又想到了最開始用的mybayes，當時還不會用集群，這個軟件是我接觸的第一個命令行了（當然，cmd改MAC碼不能算）。
mybayes肯定是linux版本的。
MrBayes | download (nbisweden.github.io)
正常編譯即可：
$ ./configure --prefix=/abyss/app/MrBayes-3.2.7a
$ make
$ make install
export PATH=/abyss/app/MrBayes-3.2.7a/bin:$PATH
寫一個腳本將格式轉換為nex，並添加mrbayes參數：
構建系統發育樹：貝葉斯法建樹 - 簡書 (ibcas.ac.cn)
可以參考上面的一些信息，我在15年也寫了一些參數選擇的事項，有些類似，不過主要用mega做的。
還有一個當年下載的鹼基替換參數NST模型（稍有整理），類似於上面這個博客說的，文件有點長，略。
1: JC F81;
2: k80 HKY;
6: TrNef TrN K81 K81uf TIMef TIM TVMef SYM GTR;
Releases · ddarriba/jmodeltest2 · GitHub (ibcas.ac.cn)
上面是一個可以用的jmodeltest版本，我后期也會將自己整理的軟件上傳到git上。
似乎沒有什么特別需要說明的東西了，我先試試。
以上，
abysw
