我這里用的是brew安裝的（為什么沒用另一種辦法，因為沒走通）。
首先，下載原始文件，https://github.com/Homebrew/brew.git
由於網絡問題，我下載的是zip文件，下載后解壓。
unzip brew-master.zip
解壓完成后，配置環境（注意：brew要求使用用戶賬號裝軟件）。
配置環境：
export LINUXBREWHOME=/abyss/git/treePL/Dependencies/brew-master
export PATH=$LINUXBREWHOME/bin:$PATH
export MANPATH=$LINUXBREWHOME/man:$MANPATH
export PKG_CONFIG_PATH=$LINUXBREWHOME/lib64/pkgconfig:$LINUXBREWHOME/lib/pkgconfig:$PKG_CONFIG_PATH
export LD_LIBRARY_PATH=$LINUXBREWHOME/lib64:$LINUXBREWHOME/lib:$LD_LIBRARY_PATH
export PKG_CONFIG_PATH=/usr/local/lib/pkgconfig:/usr/local/lib64/pkgconfig:/usr/lib64/pkgconfig:/usr/lib/pkgconfig:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/pkgconfig:/usr/lib64/pkgconfig:/usr/share/pkgconfig:$PKG_CONFIG_PATH
上述環境參考了前人的blog。
然后安裝：
brew install brewsci/bio/treepl
brew/bin/brew update
Error: Please update your system curl.
Minimum required version: 7.41.0
Your curl version: 7.29.0
Your curl executable: /usr/bin/curl
Error: Please update your system Git.
Minimum required version: 2.7.0
Your Git version: 1.8.3.1
Your Git executable: /usr/bin/git
Error: 'curl' must be installed and in your PATH!
當然不會順利：
切換為root賬戶。
更新curl：
curl http://curl.haxx.se/ca/cacert.pem -o /etc/pki/tls/certs/ca-bundle.crt
yum update curl --enablerepo=CityFanforCurl -y
vi /etc/yum.repos.d/city-fan-for-curl.repo #並寫入下列內容
[CityFanforCurl]
name=City Fan Repo
baseurl=http://www.city-fan.org/ftp/contrib/yum-repo/rhel7/x86_64/
enabled=0
gpgcheck=0
yum update curl --enablerepo=CityFanforCurl -y
更新git：git clone https://github.com/git/git.git
還是用的下載的zip文件：
unzip git-master.zip
cd git-master
make prefix=/usr/local/git all
rpm -e --nodeps git
make prefix=/usr/local/git install
ln -s /usr/local/git/bin/git /usr/bin/git
好了，切換為普通用戶：
brew install brewsci/bio/treepl
出現了新的報錯：
ld: cannot find crti.o: No such file or directory
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[3]: *** [libgcc_s.so] Error 1
make[3]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-48366-1fzd36k/gcc-5.5.0/build/x86_64-unknown-linux-gnu/libgcc'
make[2]: *** [all-stage1-target-libgcc] Error 2
make[2]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-48366-1fzd36k/gcc-5.5.0/build'
make[1]: *** [stage1-bubble] Error 2
make[1]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-48366-1fzd36k/gcc-5.5.0/build'
make: *** [bootstrap] Error 2
READ THIS: https://docs.brew.sh/Troubleshooting
報錯找不到這個文件，找一下，重新加入靜態庫。
find /usr/ -name crti*
/usr/lib64/crti.o
export LIBRARY_PATH=/usr/lib64:$LIBRARY_PATH
brew install brewsci/bio/treepl
當然還是不行的，報錯和上面的一樣。
https://github.com/Homebrew/linuxbrew-core/issues/23460
說實話，沒看懂這個帖子，反正就是gcc的安裝有問題。
brew install gcc # 沒啥用
sudo apt-get install libc6-dev #都說用這個命令，可是我的系統是centos（yum install glibc-devel，顯示已經安裝過了）
chmod 755 /usr/lib64/crti.o
再來，。。。
繼續在錯誤的邊緣作死，網上說安裝32位的可以解決，試試：
yum install glibc-devel.i686 libgcc.i686 libstdc++-devel.i686 ncurses-devel.i686
再來，。。。
ld: i386 architecture of input file `/lib/crti.o' is incompatible with i386:x86-64 output
ld: i386 architecture of input file `/lib/crtn.o' is incompatible with i386:x86-64 output
collect2: error: ld returned 1 exit status
make[3]: *** [libgcc_s.so] Error 1
make[3]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-174084-1ta7b9t/gcc-5.5.0/build/x86_64-unknown-linux-gnu/libgcc'
make[2]: *** [all-stage1-target-libgcc] Error 2
make[2]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-174084-1ta7b9t/gcc-5.5.0/build'
make[1]: *** [stage1-bubble] Error 2
make[1]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-174084-1ta7b9t/gcc-5.5.0/build'
make: *** [bootstrap] Error 2
READ THIS: https://docs.brew.sh/Troubleshooting
刪掉重來，。。。
ln -s /usr/lib64/crti.o /usr/lib/crti.o
ln -s /usr/lib64/crtn.o /usr/lib/crtn.o
checking for C compiler default output file name...
configure: error: in `/tmp/gccA5-20210913-40796-eiywp6/gcc-5.5.0/build/x86_64-unknown-linux-gnu/libgomp':
configure: error: C compiler cannot create executables
See `config.log' for more details.
make[2]: *** [configure-stage1-target-libgomp] Error 77
make[2]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-40796-eiywp6/gcc-5.5.0/build'
make[1]: *** [stage1-bubble] Error 2
make[1]: Leaving directory `/tmp/gccA5-20210913-40796-eiywp6/gcc-5.5.0/build'
make: *** [bootstrap] Error 2
READ THIS: https://docs.brew.sh/Troubleshooting
再重來
export LIBS=
export CFLAGS=
不行的。。
理論上就是用yum install glibc-devel安裝相應庫，然而我的提示之前就安裝過了，所以並不知道什么情況，我還是重裝一次吧。
最后還是放棄了，后來師兄師姐安裝上了。
如下圖：https://anaconda.org/genomedk/treepl
除了一句萬物皆可conda，只能對自己的智商感到捉急了。
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最近公眾號沒有更新，等有文章了的吧，不過廣告還是要打一下：
網站服務器沒有續費，等攢一點素材了再去續吧。
以上，
abysw
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