edgeR的使用

edgeR包是進行RNA-seq數據分析非常常用的一個R包。該包需要輸入每個基因關於每個樣本的reads數的數據，每行對應一個基因，每一列對應一個樣本。

 

安裝edgeR

先啟動R，然后運行下面代碼：
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("edgeR")

使用edgeR

library(edgeR)

 

 

REF

http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/edgeR.html

https://blog.csdn.net/hzau_yang/article/details/78118257