annData格式


1.例子

 1.1 obs

 一維觀測的注釋,是數據框類型的。通過.運算符訪問

 訪問其中的一個屬性,就通過普通的dataframe來訪問:

 1.2 var

 一維的針對特征的注釋,返回數據框類型。

1.3 uns

無結構的標注,有序字典。

這個uns的部分不是針對行/列的,而是針對行和列標注的參數的(暫時這么理解),在上述中pbmc的obs中有louvain觀測,那么在uns中就是運行louvain算法的參數。是以哈希形式存儲的。

1.4 obsm

 對觀測的多維的注釋,它是可變的ndarray,長度為n_obs,維度為2至多維。這里的m指的就是multi-dim多個維度的,和obs一個維度可以都放在一個數據框下不同。

 如上,2至多維的ndarray

1.5 varm

 描述特征的,與obsm相對。

 1.6 obsp

 針對觀測的配對的注釋,前兩維都是n_obs,

 比如點與點之間的距離和連通性。


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