MIMIC III數據集詳細介紹


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1|0MIMIC-III

免費公開的重症監護醫學信息數據庫。包含2001年至2012年之間進入重症監護病房的成年患者的53423例不同的醫院入院數據和2001年至2008年之間收治的7870名新生兒數據。

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2|0字典信息數據

字典信息數據,共包含5個數據表。抽取患者的數據比如說生命體征,心率等,實驗室指標(如白細胞紅細胞等)等, 需要在相應的字典中找到相應的item,即項目標識符,再對應查找某一個患者對應指標下的數據

2|1d_cpt

操作記錄代碼索引

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT 行號
CATEGORY SMALLINT CPT code 類別號
SECTIONRANGE VARCHAR(100) 給定的代碼范圍
SECTIONHEADER VARCHAR(50) 給定的代碼說明
SUBSECTIONRANGE VARCHAR(100) 更多有用的信息
SUBSECTIONHEADER VARCHAR(300) 更多有用的信息
CODESUFFIX VARCHAR(5) -
MINCODEINSUBSECTION INT SUBSECTIONRANGE 的最小值
MAXCODEINSUBSECTION INT SUBSECTIONRANGE 的最大值

2|2d_icd_diagnoses

診斷代碼索引

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
ICD9_CODE VARCHAR(10) ICD-9 編碼
SHORT_TITLE VARCHAR(50) 縮寫
LONG_TITLE VARCHAR(300) 全稱

2|3d_icd_procedures

手術操作代碼索引

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
ICD9_CODE VARCHAR(10) ICD-9 編碼
SHORT_TITLE VARCHAR(50) 縮寫
LONG_TITLE VARCHAR(300) 全稱

2|4d_items

記錄項目代碼索引

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
ITEMID INT 項目標識符
LABEL VARCHAR(200) 項目標簽
ABBREVIATION VARCHAR(100) 標簽縮寫
DBSOURCE VARCHAR(20) 數據來源
LINKSTO VARCHAR(50) 對應的數據表
CATEGORY VARCHAR(100) 項目種類
UNITNAME VARCHAR(100) 項目測量單位
PARAM_TYPE VARCHAR(30) 記錄數據的類型 a date, a number, a text field
CONCEPTID INT -

2|5d_labitems

化驗項目代碼索引

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
ITEMID INT -
LABEL VARCHAR(100) 項目標簽
FLUID VARCHAR(100) 測量的物質 ‘blood’ ‘urine’
CATEGORY VARCHAR(100) 測量的種類
LOINC_CODE VARCHAR(100) -

3|0患者基本信息和院內采集信息數據

患者基本信息和院內采集信息數據,共包含21個數據表

3|1admissions

患者入院情況

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT 行號
SUBJECT_ID INT 患者編號
HADM_ID INT 病案號
ADMITTIME TIMESTAMP(0) 入院時間
DISCHTIME TIMESTAMP(0) 出院時間
DEATHTIME TIMESTAMP(0) 死亡時間
ADMISSION_TYPE VARCHAR(50) 入院類型
ADMISSION_LOCATION VARCHAR(50) 入院地點
DISCHARGE_LOCATION VARCHAR(50) 出院地點
INSURANCE VARCHAR(255) 保險類型
LANGUAGE VARCHAR(10) 語種
RELIGION VARCHAR(50) 宗教信仰
MARITAL_STATUS VARCHAR(50) 婚姻狀況
ETHNICITY VARCHAR(200) 種族
EDREGTIME TIMESTAMP(0) 急診留觀登記時間
EDOUTTIME TIMESTAMP(0) 急診留觀出觀時間
DIAGNOSIS VARCHAR(300) 初步診斷
HOSPITAL_EXPIRE_FLAG TINYINT 院內死亡標記
HAS_CHARTEVENTS_DATA TINYINT 是否有chartevents記錄

3|2callout

患者ICU出科的即時信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT 行號
SUBJECT_ID INT 患者編號
HADM_ID INT 病案號
SUBMIT_WARDID INT 提交申請的科室代碼
SUBMIT_CAREUNIT VARCHAR(15) 提交申請的科室所屬的ICU cost類型
CURR_WARDID INT 患者所屬科室
CURR_CAREUNIT VARCHAR(15) 患者所屬的ICU cost類型
CALLOUT_WARDID INT 申請轉移的地方 0 代表 Home / 1 代表轉移到可用的的病房
CALLOUT_SERVICE VARCHAR(10) 患者需接受的治療服務
REQUEST_TELE SMALLINT 預防患者已經感染的疾病
REQUEST_RESP SMALLINT 預防患者已經感染的疾病
REQUEST_CDIFF SMALLINT 預防患者已經感染的疾病
REQUEST_MRSA SMALLINT 預防患者已經感染的疾病
REQUEST_VRE SMALLINT 預防患者已經感染的疾病
CALLOUT_STATUS VARCHAR(20) 申請的狀態
CALLOUT_OUTCOME VARCHAR(20) ‘Discharged’ or ‘Cancelled’
DISCHARGE_WARDID INT 實際轉移的地方 0 代表 Home / 1 代表轉移到可用的的病房
ACKNOWLEDGE_STATUS VARCHAR(20) 申請的反饋結果狀態 ‘Acknowledged’, ‘Revised’, ‘Unacknowledged’ or ‘Reactivated’
CREATETIME TIMESTAMP(0) 申請創建時間
UPDATETIME TIMESTAMP(0) 更新時間
ACKNOWLEDGETIME TIMESTAMP(0) 反饋時間
OUTCOMETIME TIMESTAMP(0) callout完成時間
FIRSTRESERVATIONTIME TIMESTAMP(0) 首次病房保留時間
CURRENTRESERVATIONTIME TIMESTAMP(0) 當前病房保留時間

3|3caregivers

護理人員信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT 行號
CGID INT 護理人員標志符
LABEL VARCHAR(15) 護理人員的頭銜 RN, MD, PharmD
DESCRIPTION VARCHAR(30) 護理人員的結構化數據信息 17 unique values

3|4chartevents

患者觀察記錄數據

Name Postgres data type In CareVue In Metavision 說明
ROW_ID INT Y Y 行號
SUBJECT_ID NUMBER(7,0) Y Y 患者編號
HADM_ID NUMBER(7,0) Y Y 病案號
ICUSTAY_ID NUMBER(7,0) Y Y ICU病案號
ITEMID NUMBER(7,0) Y Y 項目標識符
CHARTTIME DATE Y Y 記錄時間
STORETIME DATE Y Y 存儲時間
CGID NUMBER(7,0) Y Y 護理人員標識符
VALUE VARCHAR2(200 BYTE) Y Y 項目測量的值
VALUENUM NUMBER Y Y 項目測量的數字信息
VALUEUOM VARCHAR2(20 BYTE) Y Y 項目測量的值對應的單位
WARNING NUMBER(1,0) Y 測量過程發生的警告 / Metavision specific columns
ERROR NUMBER(1,0) Y 測量過程發生的錯誤 / Metavision specific columns
RESULTSTATUS VARCHAR2(20 BYTE) Y 測量類型 ‘Manual’ or ‘Automatic’ / CareVue specific columns
STOPPED VARCHAR2(20 BYTE) Y 測量是否停止

3|5cptevents

患者操作記錄,記錄程序操作是對哪位患者收費,便於知道某種操作是否執行

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT 行號
SUBJECT_ID INT 患者編號
HADM_ID INT 病案號
COSTCENTER VARCHAR(10) 操作部門
CHARTDATE TIMESTAMP(0) 操作時間
CPT_CD VARCHAR(10) 操作的原始編碼code
CPT_NUMBER INT CPT_CD 的數字信息
CPT_SUFFIX VARCHAR(5) CPT_CD 的文本后綴
TICKET_ID_SEQ INT CPT_CD 的順序
SECTIONHEADER VARCHAR(50) CPT_CD 的種類
SUBSECTIONHEADER VARCHAR(300) CPT_CD 的種類
DESCRIPTION VARCHAR(200) CPT_CD 的詳細信息

3|6datetimeevents

患者操作時間信息,包括患者在ICU中所有時間的測量。

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT 行號
SUBJECT_ID INT 患者編號
HADM_ID INT 病案號
ICUSTAY_ID INT ICU病案號
ITEMID INT 項目標識符
CHARTTIME TIMESTAMP(0) 記錄時間
STORETIME TIMESTAMP(0) 存儲時間
CGID INT 護理人員標識符
VALUE TIMESTAMP(0) 同上chartevents
VALUEUOM VARCHAR(50) 同上chartevents
WARNING SMALLINT 同上chartevents
ERROR SMALLINT 同上chartevents
RESULTSTATUS VARCHAR(50) 同上chartevents
STOPPED VARCHAR(50) 同上chartevents

3|7diagnoses_icd

患者診斷ICD-9編碼

Name PostgreSQL data type Modifiers 說明
ROW_ID INT not null -
SUBJECT_ID INT not null -
HADM_ID INT not null -
SEQ_NUM INT ICD診斷順序
ICD9_CODE VARCHAR(10) 實際編碼IDC-9

3|8drgcodes

患者診斷類別組,包含診斷所屬的種類

Name PostgreSQL data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
DRG_TYPE VARCHAR(20) 診斷類別
DRG_CODE VARCHAR(20) 診斷編碼
DESCRIPTION VARCHAR(300) 詳細描述
DRG_SEVERITY SMALLINT 嚴重程度
DRG_MORTALITY SMALLINT 死亡率

3|9icustays

ICU入住信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
ICUSTAY_ID INT ICU病案號
DBSOURCE VARCHAR(20) 來源數據庫 ‘carevue’ ‘metavision’ 在某些地方處理上有所不同
FIRST_CAREUNIT VARCHAR(20) 患者入住監護室24小時內的首個ICU監護室種類
LAST_CAREUNIT VARCHAR(20) 患者入住監護室24小時內的最終ICU監護室種類
FIRST_WARDID SMALLINT 監護室編號
LAST_WARDID SMALLINT 監護室編號
INTIME TIMESTAMP(0) 入科時間
OUTTIME TIMESTAMP(0) 出科時間
LOS DOUBLE 入住時長 可能包括單個或多個ICU單位

3|10inputevents_cv

使用carevue監護系統記錄的入量信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
ICUSTAY_ID INT -
CHARTTIME TIMESTAMP(0) 記錄時間
ITEMID INT 項目標識符
AMOUNT DOUBLE PRECISION 總入量
AMOUNTUOM VARCHAR(30) 入量單位
RATE DOUBLE PRECISION 給葯速率
RATEUOM VARCHAR(30) 速率單位
STORETIME TIMESTAMP(0) 存儲時間
CGID BIGINT 護理人員編碼
ORDERID BIGINT 同一次輸入的多個葯物進行鏈接
LINKORDERID BIGINT 同一次的單個葯物不同改變進行鏈接
STOPPED VARCHAR(30) 輸入是否暫停
NEWBOTTLE INT 新配制的溶液
ORIGINALAMOUNT DOUBLE PRECISION -
ORIGINALAMOUNTUOM VARCHAR(30) -
ORIGINALROUTE VARCHAR(30) -
ORIGINALRATE DOUBLE PRECISION -
ORIGINALRATEUOM VARCHAR(30) -
ORIGINALSITE VARCHAR(30) -

3|11inputevents_mv

使用metavision系統記錄的入量信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
ICUSTAY_ID INT -
STARTTIME TIMESTAMP(0) 入量開始時間
ENDTIME TIMESTAMP(0) 入量結束時間
ITEMID INT 項目標識符
AMOUNT DOUBLE PRECISION 總入量
AMOUNTUOM VARCHAR(30) 入量單位
RATE DOUBLE PRECISION 給葯速率
RATEUOM VARCHAR(30) 速率單位
STORETIME TIMESTAMP(0) 存儲時間
CGID BIGINT 護理人員編號
ORDERID BIGINT 同上
LINKORDERID BIGINT 同上
ORDERCATEGORYNAME VARCHAR(100) -
SECONDARYORDERCATEGORYNAME VARCHAR(100) -
ORDERCOMPONENTTYPEDESCRIPTION VARCHAR(200) -
ORDERCATEGORYDESCRIPTION VARCHAR(50) -
PATIENTWEIGHT DOUBLE PRECISION 患者體重 (kg)
TOTALAMOUNT DOUBLE PRECISION 溶液液體總量
TOTALAMOUNTUOM VARCHAR(50) 溶液液體總量單位
ISOPENBAG SMALLINT -
CONTINUEINNEXTDEPT SMALLINT 轉移是否繼續入量
CANCELREASON SMALLINT 取消原因
STATUSDESCRIPTION VARCHAR(30) 項目最終狀態 changed paused finishedrunning stopped rewritten flushed
COMMENTS_STATUS VARCHAR(30) -
COMMENTS_TITLE VARCHAR(100) -
COMMENTS_DATE TIMESTAMP(0) -
ORIGINALAMOUNT DOUBLE PRECISION -
ORIGINALRATE DOUBLE PRECISION -

3|12labevents

患者化驗項目

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
ITEMID INT 項目標識符
CHARTTIME TIMESTAMP(0) 測量時間
VALUE VARCHAR(200) 測量項目
VALUENUM DOUBLE PRECISION 測量數值數據
VALUEUOM VARCHAR(20) 測量單位
FLAG VARCHAR(20) 測量值是否異常

3|13microbiologyevents

患者標本微生物病原體檢測結果,包括采集的培養物和相關敏感性

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
CHARTDATE TIMESTAMP(0) 記錄日期
CHARTTIME TIMESTAMP(0) 記錄時間
SPEC_ITEMID INT 化驗項目標識符
SPEC_TYPE_DESC VARCHAR(100) 化驗類型 血液 尿液 痰
ORG_ITEMID INT 生成的有機物標識符
ORG_NAME VARCHAR(100) 有機物名稱
ISOLATE_NUM SMALLINT 分離菌落數目
AB_ITEMID INT 抗生素敏感性測試標識符
AB_NAME VARCHAR(30) 抗生素名稱
DILUTION_TEXT VARCHAR(10) 測試抗生素敏感性
DILUTION_COMPARISON VARCHAR(20) -
DILUTION_VALUE DOUBLE PRECISION 測試抗生素敏感性時的稀釋值
INTERPRETATION VARCHAR(5) 解釋抗生素的敏感性和試驗結果 “S”是敏感的,“R”是抗性的,“I”是中間的,“P”是待定的

3|14noteevents

治療記錄

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
CHARTDATE TIMESTAMP(0) -
CHARTTIME TIMESTAMP(0) -
STORETIME TIMESTAMP(0) -
CATEGORY VARCHAR(50) 記錄類型 ‘Discharge’ :出院
DESCRIPTION VARCHAR(300) 記錄類別 ‘Summary’ :總結
CGID INT 護理人員標識符
ISERROR CHAR(1) ‘1’ 代表該記錄被標記為錯誤
TEXT TEXT 醫囑內容

3|15outputevents

患者出量數據

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
ICUSTAY_ID INT -
CHARTTIME TIMESTAMP(0) -
ITEMID INT 項目標識符
VALUE DOUBLE PRECISION 出量值
VALUEUOM VARCHAR(30) 出量值的單位
STORETIME TIMESTAMP(0) 存儲時間
CGID BIGINT 護理人員標識符
STOPPED VARCHAR(30) 是否中斷
NEWBOTTLE INT 是否有准備新溶液
ISERROR SMALLINT 是否被標記為錯誤

3|16patients

患者信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT 患者編號
GENDER VARCHAR(5) 性別
DOB TIMESTAMP(0) 出生日期
DOD TIMESTAMP(0) 死亡日期
DOD_HOSP TIMESTAMP(0) 院內登記死亡日期
DOD_SSN TIMESTAMP(0) 社保局登記死亡日期
EXPIRE_FLAG VARCHAR(5) 死亡標記

3|17prescriptions

病人用葯記錄

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
ICUSTAY_ID INT -
STARTDATE TIMESTAMP(0) 用葯開始時間
ENDDATE TIMESTAMP(0) 用葯結束時間
DRUG_TYPE VARCHAR(100) 葯物類型
DRUG VARCHAR(100) 葯物名稱
DRUG_NAME_POE VARCHAR(100) 葯物說明
DRUG_NAME_GENERIC VARCHAR(100) 葯物說明
FORMULARY_DRUG_CD VARCHAR(120) 處方葯代碼
GSN VARCHAR(200) Generic Sequence Number
NDC VARCHAR(120) National Drug Code
PROD_STRENGTH VARCHAR(120) -
DOSE_VAL_RX VARCHAR(120) -
DOSE_UNIT_RX VARCHAR(120) -
FORM_VAL_DISP VARCHAR(120) -
FORM_UNIT_DISP VARCHAR(120) -
ROUTE VARCHAR(120) -

3|18procedureevents_mv

metavision系統操作信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT NOT NULL -
SUBJECT_ID INT NOT NULL -
HADM_ID INT NOT NULL -
ICUSTAY_ID INT -
STARTTIME TIMESTAMP(0) -
ENDTIME TIMESTAMP(0) -
ITEMID INT -
VALUE DOUBLE PRECISION -
VALUEUOM VARCHAR(30) -
LOCATION VARCHAR(30) -
LOCATIONCATEGORY VARCHAR(30) -
STORETIME TIMESTAMP(0) -
CGID INT -
ORDERID INT -
LINKORDERID INT -
ORDERCATEGORYNAME VARCHAR(100) 葯物一級分類名稱
SECONDARYORDERCATEGORYNAME VARCHAR(100) 葯物二級分類名稱
ORDERCATEGORYDESCRIPTION VARCHAR(50) 葯物分類描述
ISOPENBAG SMALLINT -
CONTINUEINNEXTDEPT SMALLINT -
CANCELREASON SMALLINT 取消原因
STATUSDESCRIPTION VARCHAR(30) 狀態描述
COMMENTS_EDITEDBY VARCHAR(30)
COMMENTS_CANCELEDBY VARCHAR(30)
COMMENTS_DATE TIMESTAMP(0)

3|19procedures_icd

病人手術記錄ICD-9編碼

Name PostgreSQL data type Modifiers 說明
ROW_ID INT not null -
SUBJECT_ID INT not null -
HADM_ID INT not null -
SEQ_NUM INT 操作順序
ICD9_CODE VARCHAR(10) ICD-9 編碼

3|20services

患者需要接受的醫療服務

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
TRANSFERTIME TIMESTAMP(0) 服務種類更改時間
PREV_SERVICE VARCHAR(20) 前次服務種類
CURR_SERVICE VARCHAR(20) 當前服務種類

1|0服務的名稱縮寫及其詳細說明

Service Description
CMED Cardiac Medical - for non-surgical cardiac related admissions
CSURG Cardiac Surgery - for surgical cardiac admissions
DENT Dental - for dental/jaw related admissions
ENT Ear, nose, and throat - conditions primarily affecting these areas
GU Genitourinary - reproductive organs/urinary system
GYN Gynecological - female reproductive systems and breasts
MED Medical - general service for internal medicine
NB Newborn - infants born at the hospital
NBB Newborn baby - infants born at the hospital
NMED Neurologic Medical - non-surgical, relating to the brain
NSURG Neurologic Surgical - surgical, relating to the brain
OBS Obstetrics - conerned with childbirth and the care of women giving birth
ORTHO Orthopaedic - surgical, relating to the musculoskeletal system
OMED Orthopaedic medicine - non-surgical, relating to musculoskeletal system
PSURG Plastic - restortation/reconstruction of the human body (including cosmetic or aesthetic)
PSYCH Psychiatric - mental disorders relating to mood, behaviour, cognition, or perceptions
SURG Surgical - general surgical service not classified elsewhere
TRAUM Trauma - injury or damage caused by physical harm from an external source
TSURG Thoracic Surgical - surgery on the thorax, located between the neck and the abdomen
VSURG Vascular Surgical - surgery relating to the circulatory system

3|21transfers

患者周轉信息

Name Postgres data type 說明
ROW_ID INT -
SUBJECT_ID INT -
HADM_ID INT -
ICUSTAY_ID INT -
DBSOURCE VARCHAR(20) 數據來源 ‘carevue’ ‘metavision’
EVENTTYPE VARCHAR(20) 轉移的類型 ‘admit’ ‘transfer’ ‘discharge’
PREV_CAREUNIT VARCHAR(20) 前次所在監護室
CURR_CAREUNIT VARCHAR(20) 當前所在監護室
PREV_WARDID SMALLINT 前次所在科室代碼
CURR_WARDID SMALLINT 當前所在科室代碼
INTIME TIMESTAMP(0) 入科時間
OUTTIME TIMESTAMP(0) 出科時間
LOS INT 住院時長


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