Pacific Bioscience SMRT技術
從測序手段來看，PacBio測序是基於光信號的三代測序技術，PacBio測序可在目標DNA分子復制的過程中捕獲序列信息（即邊合成邊測序）。PacBio測序使用一種被稱為SMRTbell的模板，這是一個通過將發夾接頭序列連接到目標雙鏈DNA分子兩端而形成的單鏈環狀DNA分子。
當SMRTbell通過被稱為SMRT cell的芯片上時，SMRTbell會擴散到被稱為零模式波導（Zero-Mode Waveguide，ZMW）的測序單元中，每個SMRT cell中含有15萬個零模式波導管。ZMW是一種直徑僅為幾十納米的納米孔，每個ZMW底部都固定有聚合酶，可以與SMRTbell的任一發夾接頭序列結合並開始復制。SMRT cell中添加有4種不同熒光基團的核苷酸，不同熒光基團被激活時會產生不同的發射光譜。當一個鹼基與聚合酶結合時，便會產生一個光脈沖被記錄下來，根據光的波長和峰值便能夠識別這個鹼基[3]。
PacBio測序的一個關鍵是將反應信號與游離鹼基的熒光背景區別出來，因為ZMW的孔徑小於波長，從底部打上去的激光不直接通過孔徑，但是可以在孔徑處發生光的衍射，僅僅能夠照射ZMW的底部區域。而DNA聚合酶就鎖定在底部的這個區域，只能被鹼基攜帶的熒光團激活並檢測到發光，從而大大減少了背景熒光的干擾。
PacBio測序的另一個關鍵是聚合酶的活性，它決定了測序的長度。DNA聚合酶的活性會在激光照射下逐漸減弱，因此不能無限長度的進行合成反應，所以DNA鏈的測序長度是有限的。此外當存在如甲基化之類的鹼基修飾時，相鄰鹼基的測序時間會變長，因此可以通過測定相鄰2個鹼基的測序時間來檢測鹼基修飾。鹼基攜帶的熒光基團可以被激活並被檢測到，從而減少背景熒光的干擾。
PacBio的測序速度很快，然而，這種測序方法的錯誤率（可達到15%）遠高於二代測序，不過因為出錯隨機，可通過增加測序深度來有效糾正測序錯誤
納米孔單分子測序技術
與基於光信號的PacBio測序不同，納米孔單分子測序技術(The Single-Molecule Nanopore DNA Sequencing)的實質是利用電信號測序的技術，
其原理是納米孔內有共價結合的分子接頭，當單個鹼基或DNA分子通過納米孔通道時，會使電荷發生變化，
從而短暫地影響流過納米孔的電流強度。
由於化學結構的差異，A、C、G和T這4種不同鹼基通過納米孔時會產生不同強度的電流，通過靈敏的電子
測序芯片展覽館：真邁生物、GenapSys、pacbio、Oxford nanopore
測序圈的各位朋友們大家好，今天我們為大家帶來了《測序芯片展覽館（下）》，上期我們展示了：illumina、ion Torrent、454 Life Sciences 三家測序儀器制造商的20款測序芯片（點擊此處回顧），本期我們為大家帶來的是Pacific Biosciences、GenapSys、GeneMind、Oxford Nanopore的7款測序芯片。
1 Pacific Biosciences SMRT Cell
圖1：Sequel II System SMRT Cell 8M的芯片，每張芯片擁有800萬個納米孔。
圖2：Sequel System SMRT Cell 1M的芯片，每張芯片擁有100萬個納米孔。
2 GenapSys GS111 sensor chip（16M Reads）
GenapSys GS111的Sensor chip擁有三種規格，1M、16M、144M Reads，目前量產的Chip為上圖中的16M Reads Chip。
3 GeneMind GenoCare1600 Flowcell
上圖為GeneMind（真邁生物）的GenoCare1600測序系統的Flowcell，該Flowcell擁有16條Lane，～320M Reads/Flowcell。
4 Oxford Nanopore Flowcell
上圖中5為PromethION Flowcell（3000個通道/FC，PromethION支持24～48張FC平行運行），6為MinION和GridION Flowcell（512個通道/FC，GridION支持最多5張FC平行運行），7為Flongle Flowcell（126個通道/FC）。
今天《測序芯片展覽館》的內容就到這里啦，后續我們將為大家帶來更多精彩內容。
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