Linux 篩選文本內容 | awk 與 grep

當你想爭對一個文本文件的特定內容進行篩選的時候，第一想到的是用awk還是grep？眾所周知(大家都知道)的是grep則以查找著稱，而awk是linux上非常強大的文本處理工具，它基本上可以滿足大部分日常需求，這篇隨筆主要想展示一下分別用這兩個工具處理以下兩個實際問題。

  * 將gff文件中注釋類型為gene的部分提取出來
  * 利用geneID從gff文件中提取該基因所在行號

awk

  `awk -F '\t' '{if($3=="gene")print $0}' The.gff > The.gene.gff'`
  `awk '/"'${geneID}'"/{print NR}' The.gene.gff`

grep

  `grep '^[gene]' The.gff > The.gene.gff`
  `grep -n ${geneID}  The.gene.gff |cut -f1 -d:`

總結
有時候合適的方法或許就是最簡單的方法，研0菜鳥，有不對的地方請嚴厲地批評我，我立馬改！！！