細菌或真菌菌種鑒定中的16S rRNA,18S rRNA等


核糖體RNA的沉降系數:“S”(沉降速度)這個單位是不能直接簡單相加的,因為它代表沉降速度的度量而不是質量。每個亞基的沉降速度既受到其形狀的影響,又受到其質量的影響。
原核細胞及真核細胞內共生體的70S核糖體中包含3種沉降系數不同的rRNA,其中30S核糖體亞基中包含16S rRNA,50S核糖體亞基中包含5S rRNA和23S rRNA。這3種rRNA在結構上有明顯的不同。即原核生物中則含23S、16S和5S 三種rRNA。
由於不同種的真細菌與古細菌間的16S rRNA基因(16S rDNA)是高度保守的,16S rRNA作為研究分類學和系統進化的分子受到很大重視,16S rRNA序列分析是當前對細菌進行分類學研究中較精確的一種技術。隨着分子生物學的快速發展以及該技術在醫學微生物研究中的應用,對16S rRNA作為微生物分類依據的研究也逐漸發展起來並已得到廣泛認同。
真核生物80S核糖體中包含4種沉降系數不同的rRNA,其中,40S核糖體亞基(小亞基)中包含18S rRNA,而60S核糖體亞基(大亞基)中包含5S rRNA、5.8S rRNA和28S rRNA。即真核細胞核糖體中通常含28S、18S、5.8S和5S 四種rRNA;真核細胞中的18S rRNA是16S rRNA的同源RNA,其相對分子質量約為0.7 MDa,長度約為1900 nt。18S rRNA除了比16S rRNA稍長且多一些臂和環結構外,兩者空間結構十分相似,在核糖體中起到的作用也基本相同。
所以就酵母而言,鑒定酵母菌株本身是需要進行18s鑒定,之所以酵母中同時出現了真核和原核的rRNA沉降系數,可能是因為該株酵母中含有共生體(線粒體,質體)。


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