淺談高中生物”鹼基對確定,求DNA最多種數”問題


前言

這個問題在高中生物中,並不會研究的那么深刻。

所以正式做題時還是應該按照老師的教導,避開這個“雷區”。

1.問題發現

在高中生物-遺傳與進化-基因的本質學習中,有一個十分經典的問題。

即:給定鹼基對數n,不限定每種鹼基(A,C,G,T)的個數,求出最多的DNA種數。

在所有的教材,輔導書,以及老師的授課過程中,對於這個問題的答案,一般都是\(4^{n}\)或者$ \frac {4^n} {2}$。

對於\(4^n\)的思路,即每個位置有\(4\)種鹼基對可能,一共有\(n\)組,根據乘法原理,故為\(4^{n}\)

對於\(\frac {4^n} {2}\)的思路,即在上一種思路的基礎上,考慮到有重復的情況,便除了個2​。

但是,@thorn,@opethrax以及本人的對於這些答案深感懷疑,於是我們便手算了當鹼基對數為\(2\)時的所有情況。

利用計算機程序進行打表,以及查詢有關\(DNA\)的資料后,最終我們確定當n=2時,結果理應為10​。

這個答案都不能用上面的公式解答,於是我們繼續思考探索。

2.深入探究

通過@opethrax同學辛苦的打表,觀察,他發現存在一些情況被忽略。

原先我們認為,一個\(DNA\)分子擁有\(3'\)\(5'\)段,\(3\)代表三號碳,\(5\)代表五號碳。

如下圖,從兩條鏈的\(3'\)端分別掃描,一種序列最多被統計到\(2\)次。

圖一

一個是AGCTA​,另一種是TAGCT。

但是,存在一種\(DNA\)分子,從其兩條鏈的\(3'\)端分別掃描,結果相同。

如下圖:

都為TCGATCGA。

所以這種情況下,具有這種性質的\(DNA\)會被少統計一次。

且我們不難發現,滿足這種性質當且僅當\(DNA\)鏈的長度為偶數(如圖一,若為奇數,會出現不對稱的情況,即不滿足這種性質)。

那么我們分類討論,之前那個\(\frac {4^n} {2}\)的公式,可以在n​為奇數時使用。

對於n​為偶數的情況,我們要在原公式的基礎上,加上少統計的個數。

現在的問題,即是尋找擁有這種特殊性質的鏈的個數。

不難發現,一條鏈的\(3'\)端的\(1\)號鹼基到該鏈的第\(\frac n 2\)號鹼基,如果和另一條鏈的\(3'\)端的\(1\)號鹼基到該鏈的第\(\frac n 2\)號鹼基相同,剩下的部分通過鹼基互補配對原則,可以保證相同。

下圖黑的部分是我們自己確定的一條排列,紅色部分是根據鹼基互補配對原則形成的。

我們可以把這個理解為一種中心對稱。

所以我們只需要構造出一條鏈中一半的排列,然后按照中心對稱放到另一條鏈的\(3'\)端,剩下那條按照鹼基互補配對原則填充即可滿足這種性質。

所以我們不難得出,這種情況下,會有\(4^{\frac {n}{2}}\)條鏈會被少統計一次。

至此,我們可以得出公式:

\[a_n=\begin{cases}\frac{4^n}{2}\ \ \ \ \ \ \ \ n=2k+1\\\frac{4^n+4^{\frac{n}{2}}}{2}\ n=2k\ \ (k\in N^*)\end{cases} \]

這個式子經過打表以及oeis.org的確認,結果正確。

3.聲明與感謝

其實\(DNA\)的結構遠比人類腦海中想象的要復雜的多,這里我們只是討論了理論下的情況。

感謝您的閱讀。若您存在任何疑問,或覺得我們有些地方存在紕漏,歡迎您聯系我們,我們十分樂意與您探討。

再次感謝兩位同學@thorn,@opethrax深夜的探討與陪伴,若沒有他們的幫助,我們很難單獨進行下去。

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opethrax有關這篇文章的鏈接:https://home.cnblogs.com/u/opethrax/

他們兩位有關這個內容的博客寫的都非常優秀,建議您去訪問他們的博客以進行更多的了解。

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4.深夜隨想

造物主強大的力量是人們無法想象到的。人類很難走到沒有任何疑惑的那一天。

每一個個體腦中冒出的新奇想法,或提出的一個問題,都有可能成為築起人類從無知到有知的橋梁下的一粒石子。

對科學的探索,不是淺嘗輒止,而是無窮無盡。

獻上一首不錯的音樂:

“生於此處卻不知此處

日光傾城,萬物生長,又是為何

若沒有大地的擁抱,我們早已消失於茫茫宇宙之中

若沒有原子之穩定,我們亦不復存在

無人問天地變換,斗轉星移,是為何故

宇宙又是源於何處

它是否無始無終

時間若願意倒流,我們的認知是否還會有局限

世間最渺小之物又是什么

滾滾長江,卻只留有過去,不知未來

浩淼宇宙,為何我們在此相遇”
——《Moonlight》


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