CAT12提取surface指標


介紹

基於表面的形態學分析(SBM)的方法被越來越多的研究者使用。本文主要介紹基於SPM12和CAT12工具包進行ROI-based SBM的處理步驟。

方法

本文數據處理使用的工具是MATLAB,SPM12和CAT12。要進行SBM的分析,需要在數據預處理階段的Segment的選項中將Writing options->Surface and thinckness estimation選項改為Yes(圖1)。這里會構建大腦的surface結構,同時會計算皮層厚度。其他的surface指標需要在CAT12的面板中的Surface Tools中的Extract Additional Surface Parametters模塊(圖2)。這些指標包括Gyrification index, Cortical complexity (fractal dimension)Sulcus depth。執行完該步驟會生成相應指標的gii文件。
提取模板ROI內指標則需要CAT12面板中的Regions of Interest Tools中的Extract ROI-based surface values模塊(圖3)。

圖1
圖1. Segmen選項

圖2
圖2. 計算其他surface指標

圖3
圖3. 提取ROI內相應指標

相關鏈接

  1. MATLAB
  2. SPM
  3. CAT


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