NMDS分析+ANOSIM組間差異顯著性檢驗


NMDS分析,即非度量多維尺度分析(non-metric multidimensional scaling)是一種將多維空間的研究對象(樣本或變量)簡化到低維空間進行定位、分析和歸類,同時又保留對象間原始關系的數據分析方法。其基本特征是將對象間的相似性或相異性數據看成點間距離的單調函數,在保持原始數據次序關系的基礎上,用新的相同次序的數據列替換原始數據進行度量型多維尺度分析。NMDS排序結果與PCA、PCoA等結果不同,它不存在排序軸的解釋量一說。因此,通常情況下我們根據應力函數值來判斷排序模型的合理性。一般情況下,應力函數值(Stress)的值不要大於0.2

 

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