1、問題描述：
今天看到公司mongodb的oplog有點大，看到雲數據庫MongoDB版日志清理策略。
MongoDB數據庫在長期頻繁地刪除/寫入數據或批量刪除了大量數據，將產生很多物理空間碎片。
這些碎片將占用磁盤空間，降低磁盤利用率。
您可以對集合中的所有數據和索引進行重寫和碎片整理，釋放未使用的空間，提升磁盤利用率和查詢性能。
下圖說明：
2、前提條件
mongo實例的存儲引擎為WiredTiger。
3、詳細信息
-
用戶禁止使用
db.repairDatabase命令。 -
日志占用空間過大時，會觸發自動清理策略。
4、注意事項
- 執行該操作前，建議對數據庫進行備份
- 執行該操作會導致集合所屬的數據庫被鎖定，且該數據庫的讀寫操作將被阻塞，請在業務低峰期操作。
- 說明：執行物理空間回收命令（compact）所需的時間與集合數據量、系統負載等因素有關。
5、remove與drop的區別
MongoDB 里刪除一個集合里所有文檔，有兩種方式
db.collection.remove({}, {multi: true})，逐個文檔從 btree 里刪除，最后所有文檔被刪除，但文件物理空間不會被回收db.collection.drop()刪除集合的物理文件，空間立即被回收
multi：可選，mongodb 默認是false,只更新找到的第一條記錄，如果這個參數為true,就把按條件查出來多條記錄全部更新。
總的來說：
新寫入的數據將會使用未被回收的物理空間，所以在數據持續寫入的場景中，不需要頻繁執行compact命令整理物理空間碎片。
有的場景，remove 了大量的數據后，后續的寫入可能並不多，這時如果想回收空間，就需要顯式的調用 compact。
6、compact 具體做了什么？
Compact 動作最終由存儲引擎 WiredTiger 完成，WiredTiger 在執行 compact 時，會不斷將集合文件后面的數據往前面空閑的空間寫，
然后逐步 truancate 文件回收物理空間。每一輪 compact 前，WT 都會先檢查是否符合 comapact 條件。
- 前面80%的空間里，是否有20%的空閑空間，用於寫入文件后面20%的數據，或者
- 前面90%的空間里，是否有10%的空閑空間，用於寫入文件后面10%的數據
如果上面都不滿足，說明執行compact肯定無法回收10%的物理空間，此時 compact 就回退出。
所以有時候遇到對一個大集合進行 compact，compact立馬就返回ok：1，集合的物理空間也沒有變化，就是因為 WiredTiger 認為這個集合沒有 compact 的必要。
7、預估回收的物理空間
1、連接mongo實例parmary或scondary
2、切換至集合所在的數據庫。
use <database_name>
3、執行下列命令查詢預估回收空間。
db.<collection_name>.stats().wiredTiger["block-manager"]["file bytes available for reuse"]
4、執行結果示例：
整理單節點實例/副本集實例的碎片
1、通過mongo shell連接MongoDB實例的Primary節點
2、切換至集合所在的數據庫。
use <database_name>
3、執行db.stats()命令查看碎片整理前數據庫占用的磁盤空間。
4、執行以下命令，對某個集合進行碎片整理。
db.runCommand({compact:"<collection_name>",force:true})
5、等待執行，返回{ "ok" : 1 }代表執行完成。
6、碎片整理完畢后，可通過db.stats()命令查看碎片整理后數據庫占用的磁盤空間
本案例碎片整理前后的對比如下圖所示：
參數說明：
<database_name>：數據庫名。 <collection_name>：集合名。 force為可選項，如您需要在副本集實例的Primary節點執行該命令，需要設置force的值為true。 compact操作不會傳遞給Secondary節點，當實例為副本集實例時，請重復上述步驟通過mongo shell連接至Secondary節點，執行碎片整理命令。
整理分片集群實例的碎片
1、通過mongo shell連接分片集群實例中的任一mongos節點
2、執行db.stats()命令查看碎片整理前數據庫占用的磁盤空間。
3、執行以下命令，對Shard節點中的Primary節點進行集合的碎片整理。
db.runCommand({runCommandOnShard:"<Shard ID>","command":{compact:"<collection_name>",force:true}})
4、執行以下命令，對Shard節點中的Secondary節點進行集合的碎片整理。
db.runCommand({runCommandOnShard:"<Shard ID>","command":{compact:"<collection_name>"},queryOptions: {$readPreference: {mode: 'secondary'}}})
參數說明：
<Shard ID>：Shard節點ID。 <collection_name>：集合名。
碎片整理完畢后，可通過db.runCommand({dbstats:1}) 命令查看碎片整理后數據庫占用的磁盤空間。