Entrez是一個搜索引擎，國家生物技術信息中心（NCBI）網站集成了 幾個健康科學的數據庫，如：如“科學文獻，DNA和蛋白質序列數據庫， 蛋白質三維結構，蛋白質結構域的數據，表達數據，基因組完整拼接本等。
Entrez的編程工具”（eUtils）：通過它把搜索的結果返回到自己編寫的程序里面， 需要提供URL，並且自己解析XML文件。 Entrez模塊，利用該模塊可以省去提供URL和解析XML的步驟。
Entrez模塊中的函數， 同時也是eUtils中具有的一些函數：
從pubmed中查找相關文獻， 所有返回的結果用Entrez.read()解析
from Bio import Entrez
my_em = 'user@example.com' db = "pubmed"
# Search Entrez website using esearch from eUtils
# esearch returns a handle (called h_search) 主要用來返回id，
h_search = Entrez.esearch(db=db, email=my_em,
term="python and bioinformatics")
record = Entrez.read(h_search) # Parse the result with Entrez.read(),record是字典
res_ids = record[“IdList”] # Get the list of Ids returned by previous search. 該鍵的值是列表
# For each id in the list
for r_id in res_ids:
# Get summary information for each id
h_summ = Entrez.esummary(db=db, id=r_id, email=my_em)
# Parse the result with Entrez.read()
summ = Entrez.read(h_summ) #返回一個列表，第一個元素是字典，不同的數據庫返回的數據的結構不一樣
print(summ[0]['Title'])
print(summ[0]['DOI'])
print('==============================================')
結果：
do_x3dna: A tool to analyze structural fluctuations of dsDNA or dsRNA from molecular dynamics simulations. 10.1093/bioinformatics/btv190
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RiboTools: A Galaxy toolbox for qualitative ribosome profiling analysis.
10.1093/bioinformatics/btv174
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Identification of cell types from single-cell transcriptomes using a novel clustering method. 10.1093/bioinformatics/btv088
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Efficient visualization of high-throughput targeted proteomics experiments: TAPIR.
10.1093/bioinformatics/btv152