R語言實現擬合神經網絡預測和結果可視化


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神經網絡一直是迷人的機器學習模型之一,不僅因為花哨的反向傳播算法,而且還因為它們的復雜性(考慮到許多隱藏層的深度學習)和受大腦啟發的結構。

神經網絡並不總是流行,部分原因是它們在某些情況下仍然存在計算成本高昂,部分原因是與支持向量機(SVM)等簡單方法相比,它們似乎沒有產生更好的結果。然而,神經網絡再一次引起了人們的注意並變得流行起來。

 在這篇文章中,我們將擬合神經網絡,並將線性模型作為比較。

數據集

波士頓數據集是波士頓郊區房屋價值數據的集合。我們的目標是使用所有其他可用的連續變量來預測自住房屋(medv)的中值。

首先,我們需要檢查是否缺少數據點,否則我們需要修復數據集。

apply(data,2,function(x)sum(is.na(x)))
 

然后我們擬合線性回歸模型並在測試集上進行測試。

index < -  sample(1:nrow(data),round(0.75 * nrow(data)))
   MSE.lm < -  sum((pr.lm  -  test $ medv)^ 2)/ nrow(test)

sample(x,size)函數簡單地從向量輸出指定大小的隨機選擇樣本的向量x

准備適應神經網絡

在擬合神經網絡之前,需要做一些准備工作。神經網絡不容易訓練和調整。

作為第一步,我們將解決數據預處理問題。
因此,我們在繼續之前分割數據:

maxs < -  apply(data,2,max) 
 scaled < -  as.data.frame(scale(data,center = mins,scale = maxs  -  mins))
train_ < -  scaled [index,]
test_ < -  scaled [-index,]

請注意,scale返回需要強制轉換為data.frame的矩陣。

參數

據我所知,雖然有幾個或多或少可接受的經驗法則,但沒有固定的規則可以使用多少層和神經元。通常,如果有必要,一個隱藏層足以滿足大量應用程序的需要。就神經元的數量而言,它應該在輸入層大小和輸出層大小之間,通常是輸入大小的2/3

 

  • hidden參數接受一個包含每個隱藏層的神經元數量的向量,而該參數linear.output用於指定我們是否要進行回歸linear.output=TRUE或分類linear.output=FALSE

Neuralnet包提供了繪制模型的好工具:

plot(nn)
 

這是模型的圖形表示,每個連接都有權重:


黑色線條顯示每個層與每個連接上的權重之間的連接,而藍線顯示每個步驟中添加的偏差項。偏差可以被認為是線性模型的截距。 

使用神經網絡預測medv

現在我們可以嘗試預測測試集的值並計算MSE。 

pr.nn < -  compute(nn,test _ [,1:13])

然后我們比較兩個MSE

顯然,在預測medv時,網絡比線性模型做得更好。再一次,要小心,因為這個結果取決於上面執行的列車測試分割。下面,在視覺圖之后,我們將進行快速交叉驗證,以便對結果更有信心。
下面繪制了網絡性能和測試集上的線性模型的第一種可視方法

輸出圖

通過目視檢查圖,我們可以看到神經網絡的預測(通常)在線周圍更加集中(與線的完美對齊將表明MSE為0,因此是理想的完美預測),而不是由線性模型。

下面繪制了一個可能更有用的視覺比較:


 交叉驗證

交叉驗證是構建預測模型的另一個非常重要的步驟。雖然有不同類型的交叉驗證方法 

然后通過計算平均誤差,我們可以掌握模型的運作方式。

我們將使用神經網絡的for循環和線性模型cv.glm()boot包中的函數來實現快速交叉驗證。
據我所知,R中沒有內置函數在這種神經網絡上進行交叉驗證,如果你知道這樣的函數,請在評論中告訴我。以下是線性模型的10倍交叉驗證MSE:

 
lm.fit < - glm(medv~。,data = data) 

 請注意,我正在以這種方式分割數據:90%的訓練集和10%的測試集以隨機方式進行10次。我也正在使用plyr庫初始化進度條,因為我想要密切關注過程的狀態,因為神經網絡的擬合可能需要一段時間。

過了一會兒,過程完成,我們計算平均MSE並將結果繪制成箱線圖

 
cv.error
10.32697995
17.640652805 6.310575067 15.769518577 5.730130820 10.520947119 6.121160840
6.389967211 8.004786424 17.369282494 9.412778105 

 

上面的代碼輸出以下boxplot:


神經網絡的平均MSE(10.33)低於線性模型的MSE,盡管交叉驗證的MSE似乎存在一定程度的變化。這可能取決於數據的分割或網絡中權重的隨機初始化。

關於模型可解釋性的最后說明

神經網絡很像黑盒子:解釋它們的結果要比解釋簡單模型(如線性模型)的結果要困難得多。因此,根據您需要的應​​用程序類型,您可能也想考慮這個因素。此外,正如您在上面所看到的,需要格外小心以適應神經網絡,小的變化可能導致不同的結果。

 

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