有關install.packages()函數的詳見：R包 package 的安裝（install.packages函數詳解）
R的包（package）通常有兩種：
1 binary package：這種包屬於即得即用型（ready-to-use），但是依賴與平台，即Win和Linux平台下不同。
2 Source package: 此類包可以跨平台使用，但用之前需要處理或者編譯（compiled）。
以下一些常用的包相關的函數：
.libPaths()：查看包的安裝目錄
library()：查看已經安裝的包目錄
library(mypackage)：載入mypackage包
getOption("defaultPackages")：查看啟動R時自動載入的包。
help(package = 'mypackage')：查看‘mypackage’的幫助
args(function)：查看函數的參數
example(function)：自動運行該函數幫助文檔中的例子，很贊！
demo("package")：展示一些包中demostration，需要再看下？？
vignette('mypackage')：有的包，特別是bioconductor的包有vignette，用函數查看
openVignette('mypackage')：這個函數也可以查看vignette，更好用一些
RSiteSearch("helpinfor")：搜索R網站上的“helpinfor”相關信息
help.start()：查看已經安裝包的詳細HTML文檔，這個命令非常爽。
更新：
search()：查看當前載入的包
sessionInfo()：查看R中載入的包
methods()：查看某個S3泛型函數中所有的方法或者一個類中所有的方法（S3：S version 3）
showMethods(class = "myClass")：查看S4類的方法
findMethods("myMethods")：查看method的代碼
class(myObject)：查看某個對象的類
getClass(“class/package”)：查看某個class或者包的具體內容
getSlots("class")：查看某個class的slot
slotNames(MyObject)：查看某個對象的slot。
可以使用Myobject@slotNames訪問對象的slot值，這個@設計實在是太爽了，可以連續用。
查詢包內信息：1. ?function/method：查看某個“函數”或者“方法”的詳細內容
2. class?graph::graph：查看“組”的詳細內容的一個例子。這個例子的來源是查詢graph包時候，查看其中class的信息，輸入??graph后出現一個graph::graph-class。
ls("package:mypackage")：查看"mypackage"中的所有對象。
安裝source package方法
1 在終端輸入 # R CMD INSTALL /.../mypackage.tar.gz
使用此方法，需要解決包依賴問題，即安裝此包所依賴的包，安裝過程有提示
2 也可以使用R的install.packages()函數安裝
回答：可以使用install.packages()函數安裝，而且比較簡便，即聯網即可裝，裝了就可用。
# R
> install.packages('mypackage')
回答2：可以使用install.packages()安裝本地下載的包，尤其適用於在服務器上安裝包
$ R
> install.packages( c("XML_0.99-5.tar.gz", "http://www.cnblogs.com/Interfaces/Perl/RSPerl_0.8-0.tar.gz"), repos = NULL, configure.args = c(XML = '--with-xml-config=xml-config', RSPerl = "--with-modules='IO Fcntl'"))
3 Bioconductor的安裝方法
> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("mypackage")
4 卸載package
remove.packages("mypackage")
remove.packages(utils)
remove.packages()所屬R語言包：utils
remove.packages(pkgs, lib)
參數：pkgs
a character vector with the names of the packages to be removed.
要刪除的軟件包的名稱與特征向量。
參數：lib
a character vector giving the library directories to remove the packages from. If missing, defaults to the first element in .libPaths().
給一個字符向量庫目錄中刪除軟件包。如果缺少，默認的第一個元素在.libPaths()
5 查看R及其package的version
R version: version 或者 R.version
R package version:
6 更新包
update.packages( ) 可以定期執行以下
7 使用別人安裝的包
修改.bashrc文件，添加環境變量R的lib路徑
export R_LIBS=/home/.../R/lib64/R/library
R中用.libPaths()函數查看lib路徑，如果有多個lib,install.packages()默認是安裝在第一個目錄下