UK Biobank專題


這個時代的生信,統計遺傳,不懂或不會用這個數據庫就說不過去了。

看看10年GWAS里是如何定位和評價UK biobank的:

For the near future, the UK Biobank is pushing the barriers further by releasing both genome-wide genotypes and rich phenotypic data on 500,000 people to the international research community.

 

Nature 4連發 - 這四篇基本把能做的分析都做了

我們應該重點關注的是這個數據挖掘的部分 - health genetics,挖掘得最好的都發在NG上了。

The UK Biobank resource with deep phenotyping and genomic data  - 介紹UK biobank數據庫的特性

Genome-wide gene-environment analyses of depression and reported lifetime traumatic experiences in UK Biobank - 之前有篇抑郁症depression的NG paper

 

UKbiobank數據是好,但是基本的分析別人早就做過了,你想再做只能往深處繼續挖掘了,否則想發NG是不可能的。

做UKbiobank最大的好處就是考驗你的數據挖掘能力,因為一般中小課題組根本拿不到這么大的項目,所以90%搞統計遺傳的一輩子都拿不到這樣規模的數據,現在UKbiobank免費給你數據,你還不偷着樂啊。

 

我現在有機會拿到現成的UKbiobank數據,但是能力不足,所以必須先看看別人是怎么做得!

 

現在最火的當之無愧就是neuron imaging的data

 

2018 - Association analysis in over 329,000 individuals identifies 116 independent variants influencing neuroticism - 沒做什么深入的分析,無非就是找到位點,做了個pathway enrichment而已。

2018 - Genome-wide analyses using UK Biobank data provide insights into the genetic architecture of osteoarthritis

2018 - Genome-wide association meta-analysis of individuals of European ancestry identifies new loci explaining a substantial fraction of hair color variation and heritability

2018 - Signatures of negative selection in the genetic architecture of human complex traits 這才是我期待的最完美的數據挖掘,自成一套的算法,再挖UKBB的數據。

 


免責聲明!

本站轉載的文章為個人學習借鑒使用,本站對版權不負任何法律責任。如果侵犯了您的隱私權益,請聯系本站郵箱yoyou2525@163.com刪除。



 
粵ICP備18138465號   © 2018-2025 CODEPRJ.COM