1. 下載安裝包
安裝包下載地址是http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/，選擇自己合適的版本，我下載1.9.3版本
2. 安裝必要庫
yum install freeglut*
3. 解壓
tar zxvf vmd-1.9.3.bin.LINUXAMD64-CUDA8-OptiX4-OSPRay111p1.opengl.tar.gz
4. configure
cd vmd-1.9.3 ./configure LINUXAMD64 # 不加后面選項會報錯
5. 編譯
cd src
make install
6. 運行
vmd