使用3D Slicer進行顱骨去除


關於3D Slicer的下載、安裝及模塊安裝在上一篇博客中以及介紹過,以下將專注於使用3D Slicer進行顱骨去除

准備

此次,我們需要安裝SwissSkullStripper模塊,安裝后需要重啟軟件才能使用該模塊

使用SwissSkullStripper模塊,如圖划線部分,點擊Help,會出現藍色鏈接,點擊可進入官網

在官網界面,我們可以看到兩個下載鏈接,這兩個圖譜文件(atlas image、atlas brain mask)是我們進行接下來操作需要使用的

下載下來之后把它們保存在無中文名字的文件夾內待用,並修改文件名分別為Atlas.mha和AtlasMask-label.mha(atlas image.mha -> Atlas.mha,atlas brain mask -> AtlasMask-label.mha)

使用

在3D Slicer中分別載入需要進行顱骨去除的文件和剛剛下載的兩個備用文件

點擊File,點擊Add Data即可出現下面載入文件的界面,將上述文件導入即可

最后一次在選擇Input, Output 和 Atlas,最后點擊Apply,即可生成去除顱骨的圖像

注意Output最好選擇Create new Volume,這樣生成的文件不會覆蓋我們之前導入的文件。Altas部分就是導入我們之前在官網下載的兩個圖譜文件

效果


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