1 MCTK重投影
第一步：安裝ENVI的MCTK擴展工具
解壓壓縮包，將其中的mctk.sav與modis_products.scsv文件復制到如圖所示，相應的ENVI安裝路徑中去。
第二步：打開ENVI5.3標准版如圖所示
在右邊的工具欄處打開最下方的Extensions工具擴展包。可以看到安裝的處理工具如圖所示。鼠標左鍵雙擊打開其中的mctk工具。
在MODIS Conversion Toolkit(MCTK)工具欄中，點擊Input HDF按鈕加載將要進行處理的MODIS數據文件（后綴名為 .hdf ）。加載數據后如圖所示。
接下來首先選擇輸出類型（Select Output Type）為第三種 Standard and Reprojected：Both output types ；定義輸出路徑（Output Path）和輸出文件名（Rootname for output）
在中間的 Processing Options 欄目中選擇項目列表（Select items from the lists：）選擇需要的數據子集（不同的數據產品中有很多個子集，具體選什么，根據自身需要選擇）。Fill Value for Bad Data：默認為 NaN ；Use Double Precision：選擇為Yes。
右邊的欄目中。選擇重采樣方法時選擇雙線性內插法（Bilinear）（總共有三種方法分別為：最鄰近法Nearest Neighbor；雙線性內插法Bilinear；三次卷積法Cubic Convolution 。使用的較多的為第二種方法，三種方法的區別可自行百度）。
選擇輸出地圖的投影（Select Output Map Projection），點擊New按鈕后，在Customized Map Projection Definition中的設置如圖所示。
投影類型選擇Albers等面積圓錐投影，投影橢球選擇WGS-84，其余參數按照圖片進行設置。第一次做的時候，設置完點擊OK，出現如下圖片，點擊是將投影參數設置保存到相應路徑內的文件下。在下一次使用時，直接點擊下圖中間的Load Existing Projection即可完成投影參數設置。
最后將背景值（Background Value To Use）設置為-999。點擊Process按鈕即可完成。
2 數據重采樣
首先將要進行重采樣的數據打開，然后在ENVI中右邊的工具欄處，打開Raster Management工具包。選擇其中的Resize Data工具如圖所示。鼠標左鍵雙擊，打開Resize Data Input File對話框。
在Resize Data Input File對話框中選擇數據文件，點擊OK，進入Resize Data Parameters對話框。
點擊Set Output Dims by Pixel Size按鈕，在Output Dims via Pixel Size對話框中設置輸出的像元尺寸X、Y均為500米。點擊OK。
選擇重采樣方法時選擇雙線性內插法（Bilinear）（總共有三種方法分別為：最鄰近法Nearest Neighbor；雙線性內插法Bilinear；三次卷積法Cubic Convolution ）。（當由低分辨率轉為高分辨率時會無法選擇這三種方法，只有 Nearest Neighbor和aggregate方法）。最后合適的輸出路徑與文件名，點擊OK按鈕即可。
3 研究區提取
打開要提取的文件與研究區的面矢量圖。
在ENVI中右邊的工具欄處，打開Regions of Interest工具包。選擇其中的Subset Data from ROIs 工具如圖所示。鼠標左鍵雙擊，打開Select Input File to Subset via ROI對話框。選擇要提取的原始文檔，點擊OK，進入Spatial Subset via ROI Parameters對話框。
在Spatial Subset via ROI Parameters中選擇寧夏矢量面文件，Mask pixels output of ROI 選擇Yes，Mask Background Value設為-999（根據數據處理需要自行設定）。定義文件輸出路徑與文件名。點擊OK即可。