Clustalx的操作
第一步：輸入序列文件。
第二步：設定比對的一些參數。
參數設定窗口。
第三步：開始序列比對。
第四步：比對完成，選擇保存結果文件的格式
相關問題
CLUSTALX－是CLUSTAL多重序列比對程序的Windows版本。Clustal X為進行多重序列和輪廓比對和分析結果提供一個整體的環境。
這里總結一下在使用ClustalX做序列比對過程中一些常見的問題~
1，從網上看來說CLUSTALX軟件使用的時候，開始要輸入FASTA格式准備的DNA序列test.seq文件。請問這種文件怎么生成啊?記事本?
其實沒有規定的文件名，不一定是叫test.seq，任何你想要的都可以，除了中文名（下面會說明）。主要里面的內容是正確的格式就行了~。Clustal支持的格式有多種，如NBRF/PIR, EMBL/SWISSPROT, Pearson (Fasta), Clustal (*.aln), GCG/MSF (Pileup), GCG9/RSF and GDE等
2，什么使用ClustalX時，總是導入不了序列，出現 ERROR:Can not open output file??
這個問題挺多人碰到過的~這是因為你導入的文件的路徑包含有中文名。把文件放在其它地方看看。最好路徑也不要有空格了。當然前提是你的格式要正確了。這個問題同樣適用於ClustalW或其它dos類的軟件
3，ClustalX比對后的結果中.aln文件是什么？
這個是序列比對結果的文件。關於這部分，你可以看如何把clusterX的結果轉為漂亮的圖片
4，ClustalX比對后的結果中.dnd文件是什么？
這個文件是系統進化樹文件，需要裝TreeView軟件才能看（用Dnaman也可以的），進化樹顯示工具TreeView的下載地址：http://taxonomy.zoology.gla.ac.uk/rod/treeview.html