ADNI數據集相關概念整理

數據類型

 

1. 臨床
2. 遺傳
3. MRI圖像
4. PET圖像
5. 生物樣本

臨床

• ADNI臨床數據集包括關於每個受試者的臨床信息，包括招募，人口統計學，身體檢查和認知評估數據。可以將整套臨床數據作為逗號分隔值（CSV）文件批量下載。
• ADNI臨床數據由阿爾茨海默氏症治療研究所（ATRI）收集和管理。
• 下表總結了收集的臨床數據
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遺傳

• 遺傳因素在阿爾茨海默病中起重要作用。因此，ADNI的一個關鍵目標是為研究人員提供將遺傳學與成像和臨床數據相結合的機會，以幫助研究疾病的發病機制。已經為ADNI 1，ADNI GO和ADNI 2受試者生成了基因分型和測序數據，並且可供ADNI研究人員使用。
• 可用數據摘要如下：
• 基因數據: ILLUMINA SNP基因分型檢測

1. ADNI的一個關鍵目標就是為研究人員提供機會，將遺傳學、影像學和臨床數據結合起來，幫助研究該病的機制
2. SNPs -- 單核苷酸多態性（single nucleotide polymorphisms）
3. GWAS -- 全基因組關聯研究（Genome-Wide Association Studies）
4. WGS -- 全基因組測序
5. APOE的4等位基因是已知的AD最強大的遺傳風險因素，如果擁有一個4等位基因的人患AD的風險增加了2- 3倍，那么如果有兩個等位基因的人患AD的風險增加了12倍。
6. GWAS采用標記物(單核苷酸多態性(SNPs))和感興趣的表型之間的關聯測試。病例對照GWAS和其他類型的遺傳關聯研究的結果可以為檢測ADNI成像和其他生物標志物數據集派生的定量表型提供靶點。

MRI圖像

• MRI圖像-磁共振成像，英文全稱是：Magnetic Resonance Imaging，包括：原始、預處理和后處理的圖像文件，FMRI和DTI。
• MRI圖像的收集對於滿足ADNI開發生物標記物以追蹤阿爾茨海默病的進展和潛在病理學變化的目標至關重要。
• 下表顯示了整個ADNI研究中收集的MRI數據的概述

PET圖像

• PET：正電子發射型計算機斷層顯像（Positron Emission Computed Tomography），是核醫學領域比較先進的臨床檢查影像技術。
• PET圖像的收集對於滿足ADNI開發生物標記物以追蹤阿爾茨海默病的進展和潛在病理學變化的目標至關重要。
• 下表為收集到的數據：
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• 可用數據圖像

生物樣本

• ADNI的目標之一是收集參與者的血液，尿液和腦脊液（CSF）等生物樣本。
• 各階段提取的生物樣本

1. ADNI 1 BIOSPECIMEN COLLECTION

2. ADNI GO BIOSPECIMEN COLLECTION

3. ADNI 2 BIOSPECIMEN COLLECTION

•  相關名詞解釋

1. CSF-腦脊髓液（Cerebrospinal Fluid）
2. Plasma from Blood-血漿
3. Serum from Blood-血清
4. Buffy Coat-白細胞層

 

參考文獻：

http://adni.loni.usc.edu/