miRbase 是miRNA 的數據庫，目前最新版本為 release 21, 共有28645 條 miRNA, 第22 版已經完成，即將發布，22版新增了10000 個miRNA, 大多來源於新的物種。
21版的數據庫中收錄了 223 個物種的miRNA, 根據 phylum 水平分成以下幾類：
1）Metazoa ： 后生動物
最常見的人， 小鼠， 大鼠， 雞， 狗， 牛， 羊等等
2） Viridiplantae ： 綠色植物界
最常見的擬南芥， 水稻， 玉米，小麥，大麥等等
3）Chromalveolata ： 囊泡藻界
4）Mycetozoa ：黏菌
5） Viruses ： 病毒
網址：
http://www.mirbase.org/index.shtml