嵌合體序列由來自兩條或者多條模板鏈的序列組成,示意圖如下:
在PCR反應中,在延伸階段,由於不完全延伸,就會導致嵌合體序列的出現,以上圖為例,
在擴增序列X的過程中,在序列延伸階段,只產生了部分X序列延伸階段就結束了,在下一輪的PCR反應中,這部分序列作為序列Y的引物接着延伸,擴增就會形成X和Y的嵌合體序列;
在放一張具體一點的示意圖,不完全延伸產生的序列作為下一輪PCR反應的產物,進行延伸
在PCR過程中,大概有1%的幾率會出現嵌合體序列,所以在16S 擴增子測序的分析中,需要去除嵌合體序列
參考資料:http://drive5.com/usearch/manual/chimera_formation.html