你能給別人講清楚這個概念嗎？
二代測序中，每測一個鹼基會給出一個相應的質量值，這個質量值是衡量測序准確度的。鹼基的質量值13，錯誤率為5%，20的錯誤率為1%，30的錯誤率為0.1%。行業中Q20與Q30則表示質量值≧20或30的鹼基所占百分比。例如一共測了1G的數據量，其中有0.9G的鹼基質量值大於或等於20，那么Q20則為90%。
Q20值是指的測序過程鹼基識別（Base Calling）過程中，對所識別的鹼基給出的錯誤概率。
質量值是Q20，則錯誤識別的概率是1%，即錯誤率1%，或者正確率是99%；
質量值是Q30，則錯誤識別的概率是0.1%，即錯誤率0.1%，或者正確率是99.9%；
質量值是Q40，則錯誤識別的概率是0.01%，即錯誤率0.01%，或者正確率是99.99%；
首先，鹼基質量值是衡量測序質量的重要指標，質量值（Q）越高代表鹼基被測錯的概率（P）越小，其計算公式為Q=-10lgP。例如，Q20和Q30分別代表鹼基被測錯的概率為1%和1‰。Illumina官方一般以Q30作為評價標准，以目前最常用的HiSeq 2000平台2×100PE測序為例，Illumina官方保證大於80%鹼基准確度達Q30，而千年基因在合同中嚴格保證大於85%鹼基准確度達Q30。
總結：
測序時每個鹼基都會有質量值，我們設定一個閾值：20或30，如果低於這個閾值就表示鹼基基本是測序錯誤的鹼基，對測序的每個鹼基做統計，如果
測序時每個鹼基都會有質量值，如鹼基質量值為20則表示該鹼基的錯誤率為，10^（20/(-10)）=0.01=1%（根據Q=-10lgP計算）
行業中，為了評估下機reads測序的准確度，我們會評估Q20或Q30（及所有鹼基質量值大於20或30所占的比例），一般合同中要嚴格保證Q30至少達到85%。
是不是明白了呢？