原文:測序中Q20 Q30 Q40

你能給別人講清楚這個概念嗎 二代測序中,每測一個鹼基會給出一個相應的質量值,這個質量值是衡量測序准確度的。鹼基的質量值 ,錯誤率為 , 的錯誤率為 , 的錯誤率為 . 。行業中Q 與Q 則表示質量值 或 的鹼基所占百分比。例如一共測了 G的數據量,其中有 . G的鹼基質量值大於或等於 ,那么Q 則為 。 Q 值是指的測序過程鹼基識別 Base Calling 過程中,對所識別的鹼基給出的錯誤概率。 ...

2017-01-09 14:40 0 15255 推薦指數:

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raw data/PF data/Q30 data/clean data的不同

測序數據拿回來之后,會給一些數據。那么這些數據代表什么呢? 1. 原始數據(Raw data):一次測序產生的全部原始數據。理論上,它們應該是沒有經過任何過濾的,無論好壞。 2. PF數據(PF data):在測序過程,Illumina內置軟件根據每個測序片段(read,通常每個片段長100 ...

Mon Jan 07 22:16:00 CST 2019 0 1086
統計 fastq 文件 q20 , GC 含量的軟件

二代測序的分析過程,經常需要統計原始下機數據的數據量,看數據量是否符合要求;另外還需要統計q20,q30,GC含量等反應測序質量的指標; 在kseq.h 的基礎上稍加改造,就可以實現從fastq 文件中統計這些指標的功能,而且速度非常的快 源代碼保存為 parse.c ...

Tue Feb 14 22:56:00 CST 2017 6 2483
DjangoQ查詢及Q()對象

DjangoQ查詢及Q()對象 問題 一般我們在Django程序查詢數據庫操作都是在QuerySet里進行進行,例如下面代碼: 或者將其組合起來,例如: 隨着我們的程序越來越復雜,查詢的條件也跟着復雜起來,這樣簡單的通過一個filter()來進行查詢的條件將導致我們的查詢越來越 ...

Tue Oct 22 04:10:00 CST 2019 0 1154
DjangoQ查詢及Q()對象

問題 一般我們在Django程序查詢數據庫操作都是在QuerySet里進行進行,例如下面代碼: >>> q1 = Entry.objects.filter(headline__startswith="What") >>> q ...

Tue Dec 12 23:23:00 CST 2017 0 17773
Angularjs的$q詳解

先說說什么是Promise,什么是$q吧。Promise是一種異步處理模式,有很多的實現方式,比如著名的Kris Kwal's Q還有JQuery的Deffered。 什么是Promise 以前了解過Ajax的都能體會到回調的痛苦,同步的代碼很容易調試,但是異步回調的代碼,會讓開 ...

Fri Jun 16 18:07:00 CST 2017 0 4420
Q-Q

來自:https://mp.weixin.qq.com/s/_UTKNcOgKQcCogk2C2tsQQ   正負樣本數據集符合獨立同分布是構建機器學習模型的前提,從概率的角度 ...

Fri Jan 04 00:01:00 CST 2019 0 1670
angular的$q詳解

AngularJS 的Promise --- $q服務詳解 先說說什么是Promise,什么是$q吧。Promise是一種異步處理模式,有很多的實現方式,比如著名的Kris Kwal's Q還有JQuery的Deffered ...

Fri Apr 27 06:46:00 CST 2018 0 1823
 
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