對於芯片或者其它表達數據來說，最常見的莫過於quantile normalization啦。
那么它到底對我們的表達數據做了什么呢？首先要么要清楚一個概念，表達矩陣的每一列都是一個樣本，每一行都是一個基因或者探針，值就是表達量咯。quantile normalization 就是對每列單獨進行排序，排好序的矩陣求平均值，得到平均值向量，然后根據原矩陣的排序情況替換對應的平均值，所以normalization之后的值只有平均值了。
具體看下面的圖：
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