cmd 輸入命令 netstat -ano 查看所有端口的占用情況； 6080，4000-4004是Server的默認端口，根據PID在任務管理器中查看占用端口的進程。如果是被Server啟動的兩個javaw.exe進程占用則正常，否則可以通過查看進程屬性確定是哪個應用程序占用了該端口。
可以通過進入admin目錄，修改Server的4000-4004端口為其他空閑的端口。
admin目錄： 瀏覽器輸入路徑，如：http://您的ip:6080/arcgis/admin/machines/這里是您的機器名/edit
或者把Server manager的路徑中 manager 修改為 admin/machines/這里是您的機器名/edit
修改Ports中4000端口為其他空閑端口（一般改成4005或4006就行）， 修改后會自動重啟。
參考官方幫助文檔：
http://resources.arcgis.com/zh-cn/help/main/10.1/index.html#//015400000590000000
http://resources.arcgis.com/zh-cn/help/main/10.1/index.html#//015400000537000000