Global Alignment(全局比對)--從算法(Needleman-Wunsch)到python實現


很早就知道有全局比對和局部比對這兩種比對方法,都是用到的動態規划的思想,知道一些罰分矩陣的概念,但一直都沒有機會搞透徹,一些算法的細節也不太清楚,也沒有親手編程實現。

現在由於項目需求,需要手動寫一個簡單的全局和局部比對的程序,同時得知團隊里有個大牛早就用Perl實現了,看了一下他的代碼也才100行,於是我打算從頭開始全面的弄懂算法的每一個細節,然后再用python實現一遍。


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