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本文由整理網上資料和總結個人經驗創作
很多人在安裝雙系統（如C盤XP，D盤Vista/Win7）時，硬盤的分區狀況是一個活動的主分區，若干個邏輯分區；或者多個主分區但活動主分區安裝時不改變。
此時的雙系統不是彼此獨立的，若C盤是活動主分區，在上例中，XP和Vista/Win7的引導文件都是放在C區。這樣往往會產生一些問題：C盤數據的損壞可能導致兩個系統都不能進入，C盤的格式化或系統重裝造成無法啟動D盤系統，等等。XP、Vista/Win7安裝順序的不同也可能造成無法啟動部分系統。
怎么避免這些問題？雙主分區獨立雙系統不失為一個辦法！
一、簡要介紹和准備工作
# 優勢
雙主分區獨立雙系統的XP，Vista/Win7分別安裝在兩個不同的主分區中（注意，安裝系統時，准備裝入系統的主分區必須標記為活動主分區，否則就會和一個主分區，若干邏輯分區的情況沒有區別。這也是我們為什么要用多個主分區的原因，因為邏輯分區不能標為活動分區），互不影響，彼此獨立。各系統的引導文件僅在其所在的主分區內，一個主分區的格式化或該主分區內系統的損壞、重裝絲毫不會影響另一主分區內系統的使用。安裝多系統時也沒有必須先裝誰后裝誰的問題。
# 磁盤工具：備份PBR（分區引導記錄）的軟件
PBR在分區引導扇區中，XP、Vista/Win7下使用winhex備份，該軟件網上有破解版下載。
# 系統安裝順序
任意，先XP后Vista/Win7，先Vista/Win7后XP都可以。
# 硬盤分區
划分2個主分區，一個安裝XP，另一個安裝Vista/Win7，並假設將XP安裝在第一個分區。
注：在XP和Vista/Win7的“磁盤管理”里可以改變活動分區，在主分區上點右鍵，在右鍵菜單中點選“將磁盤分區標為活動的”。若采用PQ分區，XP下boot.ini引導Vista/Win7可能會出現問題，請用XP、Vista/Win7自帶的分區工具或其它經驗證適用的第三方軟件分區，如：英文版的“Acronis Disk Director Suite 10.0.2160”（其目前的漢化版存在問題，請謹慎使用）或者“Eisoo DiskGenius V3.2.2010.5”。
# XP 、Vista/Win7啟動過程
XP的啟動：Bios-->MBR-->BR-->ntldr-->boot.ini-->win kernel；
Vista/Win7的啟動：Bios-->MBR-->BR-->bootmgr-->boot\BCD-->win kernel
獨立雙系統的安裝並不復雜，重點和難點在於雙系統啟動菜單的制作。我們通過使用記事本修改boot.ini，或使用bcdedit.exe修改boot\BCD來分別制作XP、Vista/Win7下的雙系統啟動菜單。
二、安裝系統並制作啟動菜單
A. 先裝XP再裝Vista/Win7
1、激活第一個主分區（即將第一個主分區標為活動的。如已激活跳過此操作），在此分區安裝XP，重啟計算機進入XP
2、在XP下，將PBR保存為文件PBR1
保存方法：運行winhex，按“F9”，選擇“物理磁盤”，點到當前系統（此時為XP）所在的磁盤分區，然后點擊菜單：編輯--復制扇區--快捷鍵是“Ctrl+Shift+N”那一項，輸入文件名“PBR1”即可
3、激活第二個主分區，在此分區安裝Vista/Win7，重啟計算機進入Vista/Win7
4、在Vista/Win7下，將PBR保存為PBR2
保存方法：運行winhex，按“F9”，選擇“物理磁盤”，點到當前系統（此時為Vista/Win7）所在的磁盤分區，然后點擊菜單：編輯--復制扇區--快捷鍵是“Ctrl+Shift+N”那一項，輸入文件名“PBR2”即可
（制作Vista/Win7雙系統啟動菜單）
5、在Vista/Win7下，將保存的PBR1復制到Vista/Win7分區的根目錄下
6、用管理員權限運行cmd，然后依次輸入執行如下命令行：
bcdedit /create /d "Windows XP" /application bootsector *運行后會返回所創建新項的ID，如{a1b6c8}
set id={a1b6c8} *項ID由計算機自動生成，此處為方便說明而使用上例
bcdedit /set %id% locale zh-cn
bcdedit /set %id% device partition=C:
bcdedit /set %id% path \PBR1
bcdedit /set %id% description "Windows XP"
bcdedit /displayorder %id% /addlast
（制作XP雙系統啟動菜單）
5、激活第一個分區（XP所在主分區），重啟進入XP
6、在XP下，將保存的PBR2復制到XP分區的根目錄下，用記事本打開boot.ini，在里面添加一行：
C:\PBR2="Microsoft Windows Vista/Win7 Ultimate" *引號內信息可隨意填寫，下同
B. 先裝Vista/Win7再裝XP
1、激活第二個分區（如已激活跳過此操作），安裝Vista/Win7，並重啟進入Vista/Win7
2、在Vista/Win7下，將PBR保存為PBR2。方法見A
3、激活第一個主分區，然后安裝XP，並重啟進入XP
4、在XP下，將PBR保存為PBR1。方法見A
（制作XP雙系統啟動菜單）
5、在XP下，將保存的PBR2復制到XP分區的根目錄下，在boot.ini里面添加一行
C:\PBR2="Microsoft Windows Vista/Win7 Ultimate "
（制作Vista/Win7雙系統啟動菜單）
5、激活第二個分區，重啟進入Vista/Win7，將保存的PBR1復制到Vista/Win7分區的根目錄下
6、用管理員權限運行cmd，然后依次輸入執行如下命令行
bcdedit /create /d "Windows XP" /application bootsector *運行后會返回所創建新項的ID，如{a1b6c8}
set id={a1b6c8} *項ID由計算機自動生成，此處為方便說明而使用上例
bcdedit /set %id% locale zh-cn
bcdedit /set %id% device partition=C:
bcdedit /set %id% path \PBR1
bcdedit /set %id% description "Windows XP"
bcdedit /displayorder %id% /addlast
三、取消雙系統
a.要取消Vista/Win7啟動菜單中的XP系統，激活第二個主分區，啟動進入Vista/Win7，用管理員權限運行cmd，然后輸入執行如下命令行
bcdedit /delete {a1b6c8} *此處為方便說明而使用上例
b.要取消XP啟動菜單中的Vista/Win7系統，激活第一個主分區，啟動進入XP，刪除boot.ini中的C:\PBR2="Microsoft Windows Vista/Win7 Ultimate" 即可