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K-mer分析

0. 基本参数   基因组大小:G   Read读长:L   总Read条数:n_r 1. 碱基深度分布     单条Read测序覆盖到某一个碱基的概率:L/G   因为L/G很小,n_r ...

Sat Nov 03 09:52:00 CST 2018 0 2392
全基因组数据分析原始数据到变异数据(Fastq->VCF)

WGS数据分析目的:检测出每个样本基因组中的变异集合(不同样本中的差异序列)WGS数据分析流程分为三步:原始数据质控 -> 数据预处理 -> 变异检测1.原始数据质控阶段:拿到原始测序数据 ...

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常用生信分析软件

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Sat Nov 03 06:05:00 CST 2018 0 906
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主要有5款软件,MutationTaster>Provean>PolyPhen2 >MutationAssessor>SIFT MutationTaster:通过检测 ...

Tue Mar 24 00:37:00 CST 2020 0 778

 
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