bam文件softclip ， hardclip ，markduplicate的探究

  测序产生的bam文件，有一些reads在cigar值里显示存在softclip，有一些存在hardclip，究竟softclip和hardclip是怎么判断出来的，还有是怎么标记duplicate的reads的，我怀着这些问题进行了探究。 测试步骤 编辑两个bed文件，分别含有 ...