版权声明:本文为博主原创文章,转载请注明出处 R语言data.table包是自带包data.frame的升级版,用于数据框格式数据的处理,最大的特点快。包括两个方面,一方面是写的快,代码简洁,只要一行命令就可以完成诸多任务,另一方面是处理快,内部处理的步骤进行了程序上的优化 ...
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R语言处理大规模数据速度不算快,通过安装其他包比如data.table可以提升读取处理速度。 案例,分别用read.csv和data.table包的fread函数读取一个1.67万行、230列的表格数据。 参考资料: R语言data.table速查(博客园 ...
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由于基因组数据过大,想进一步用R语言处理担心系统内存不够,因此想着将文件按染色体拆分,发现python,awk,R 语言都能够非常简单快捷的实现,那么速度是否有差距呢,因此在跑几个50G的大文 ...