GEO数据下载分析（SRA、SRR、GEM、SRX、SAMN、SRS、SRP、PRJNA全面解析）
很多时候我们需要从GEO（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）下载RNA-seq数据，一个典型的下载页面是https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ge ...
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RNA sequence单分子直测技术
生命组学 按照功能分类遗传物质，可能的分类有系统流、操作流、平衡流等等。下面是使用该理论解释DNA与RNA的关系： DNA和RNA有很大不同，DNA存储遗传信息，作为生命活动的最内核物质，如同操作 ...
[bio] STAR 通用超快的RNA aligner
rna call varients时gatk推荐工具，broad institute都推荐了，还是encode计划时冷泉港内部开发的，特点：超级快速（8min map完6gb的reads）、as支持性 ...
lncRNA表达定量方法评估
见文章：Benchmark of lncRNA Quantification for RNA-Seq of Cancer Samples Overall, 10-16% of lncRNAs can ...