原文:单细胞空间转录组 | scRNA-seq

实验室马上要开始做heart的单细胞空间转录组,需要提前了解一下基本的data。 废话不多说,先把示例数据和教程跑一遍,找找感觉。 参考:Seurat . 系列教程 :空间转录组的分析 可视化与整合 样本制备 获取高质量数据的前提 参考: Visium Spatial Gene Expression x Genomics NC 单细胞空间转录组学联合揭示鸡胚心脏发育过程 可以直接借鉴 单细胞文章 ...

2021-12-16 19:02 0 138 推荐指数:

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单细胞转录测序技术(scRNA-seq)及细胞分离技术分类汇总

单细胞测序流程(http://learn.gencore.bio.nyu.edu) 在过去的十多年里,高通量测序技术被广泛应用于生物和医学的各种领域,极大促进了相关的研究和应用。其中转录测序(RNA-seq)被广泛应用于测定和描绘各类物种的基因或转录 ...

Sat Sep 07 23:23:00 CST 2019 0 1442
scRNA-seq单细胞测序数据分析工具汇总

本文总结自一篇综述: Computational approaches for interpreting scRNA-seq data 单细胞分析分为两个层次: cell level gene level Tools for the visualization ...

Thu Jul 13 02:13:00 CST 2017 0 6366
单细胞转录测序技术原理

From: https://mp.weixin.qq.com/s/4dtXwK1KTLXndGvO5m2BEQ 单细胞测序主要涉及单细胞基因测序和转录测序两个方面,分别针对单细胞DNA及RNA进行序列分析和比较。单细胞测序一直是科学家关注的一个热点。单细胞基因测序目前主要有两种扩增 ...

Wed Jun 30 17:19:00 CST 2021 0 525
单细胞转录CNV分析

什么是CNV? copy number variation (CNV) A copy number variation (CNV) is when the number of copies of ...

Fri May 07 22:49:00 CST 2021 0 210
scRNA-seq数据获得(R包scRNAseq)

R bioconductor中的scRNAseq数据包是专门提供scRNA-seq数据的包。 1.Introduction scRNA-seq包提供了一个方便的途径来获得公开的数据集,这些数据集是以SingleCellExperiment 格式存储的。 查看表达数据矩阵: 2. ...

Thu Jan 07 01:21:00 CST 2021 0 629
 
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