长链非编码RNA(lncRNA) 转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过 ...
基本问题: RNA的起源 定位和意义 明确RNA的各种概念分类 各种RNA的基本结构和功能 意义 有一种学说:RNA是生命的起源。 先有鸡 DNA 还是先有蛋 蛋白质 ,好像都不太可能,那有没有可能先有RNA 桥接了DNA和蛋白质,RNA本身也是一种酶。 分类 首先按是否coding,分coding RNA和non coding RNA Coding RNAs generally refers t ...
2021-12-15 13:49 0 813 推荐指数:
长链非编码RNA(lncRNA) 转自:http://blog.sina.com.cn/s/blog_909da11301010bkz.html 长链非编码RNA(lncRNA)是一类转录本长度超过 ...
RNA的重要调控功能发现历程(Rinn et al. Annu Rev Biochem, 2013) 长非编码RNA,英文名为long noncoding RNAs,缩写为lncRNA,是指长度大于200 核苷酸的非编码RNA。LncRNA因具有非常重要 ...
单细胞转录组确实是利器,但我们大多只利用了表达的信息,而从reads到表达之间的信息完全被我们忽略了。 最近nature发了一篇单细胞方法类文章,讲得就是如何利用RNA velocity来做细胞发育路径的推断。 velocyto velocyto-notebooks RNA ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 ...
一个比原版更好用的RNA velocity分析工具:velocyto GitHub:https://github.com/velocyto-team/velocyto.R readthedoc:http://velocyto.org/velocyto.py/index.html 历史 ...
单细胞测序 RNA velocity | RNA速率 RNA velocity:the time derivative of the gene expression state—can be directly estimated by distinguishing between ...
在提取生物总RNA的过程中,被提取的RNA主要包含三类——rRNA,tRNA,和mRNA。 无论是在真核生物细胞中还是在原核生物细胞中,80%-85%的RNA都是rRNA,即核糖体RNA,是组成核糖体的主要成分。 原核生物的核糖体所含的rRNA有5S rRNA、16S rRNA、23S ...
ERCC的调研 在RNA-seq数据分析中,为了比较不同样本、不同基因之间的表达差异,通常会对数据进行标准化转化,得到RPKM/FPKM/TPM等指标。但是这些指标都是相对定量,相对定量有两个前提:1是绝大多数的gene表达量不变;2是高表达量的gene表达量不发生改变。 可是在一些比较特殊 ...