原文:单细胞测序 10x genomics

单细胞转录组 从研究方向看上,发育生物学 免疫 神经生物学 肿瘤是排名靠前的方向,这和我们平时遇到的高频研究方向基本吻合。另外,作为一个新兴的领域, X 单细胞转录组检测到细胞多,数据庞大,信息复杂,对数据分析带来诸多困难,因此算法类的文章 Computational method 也高达 篇。 从物种上看,小鼠和人牢牢占据主流。毕竟人类医学研究还是生物领域的最大热门,小鼠也是头号模式动物。其他 ...

2021-06-30 17:14 0 223 推荐指数:

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单细胞 RNA-seq 10X Genomics

单细胞流程跑了不少,但依旧看不懂结果,是该好好补补了。 有些人可能会误会,觉得单细胞的RNA-seq数据很好分析,跟分析常规的RNA-seq应该没什么区别。今天的这篇文章2015年3月发表在Nature Genetics Review上,专门说明了一下单细胞RNA测序数据在数据分析和计算 ...

Sat May 27 00:06:00 CST 2017 0 13409
10X单细胞测序细胞分类

介绍 文章对已知的多种细胞系混合后进行单细胞10X RNA测序,研究多克隆之间的互作模式。我们这里介绍里面的单细胞测序基因表达细胞分类操作。不过文章选用的是已知固有SNP进行分类,基因表达分类用于和SNP分类进行比较。 代码讲解 读入QC后的seurat obj,过滤代码见之前的博客http ...

Thu Feb 04 19:34:00 CST 2021 0 359
单细胞测序 UMI 10X Barcode

mRNA 的数量。10X genomics单细胞测序通过Barcode来标记细胞,UMI 来标记转录本 ...

Sat Jun 26 16:53:00 CST 2021 0 2623
单细胞测序学习(一)

一、单细胞测序简介   单细胞测序技术(single cell sequencing)是指在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术,它能够弥补传统高通量测序的局限性,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性。   我们经常看到的scRNA-seq ...

Thu Oct 29 17:13:00 CST 2020 0 658
单细胞测序学习(二)

三、单细胞测序原理   今天主要介绍单细胞测序原理。10X Genomics和BD Rhapsody是目前单细胞测序的两大主流平台,所以今天的单细胞测序原理介绍也是基于这两个平台的。  (1)10X Genomics单细胞测序原理         上图是10X单细胞测序的原理图。首先要 ...

Thu Oct 29 17:19:00 CST 2020 0 1281
单细胞测序的知识

单细胞测序的知识 刘小泽 已关注 2018.07.20 21:33* 字数 1885 阅读 675评论 0喜欢 7 刘小泽写于18.7.20https://hemberg-lab.github.io ...

Sat Oct 20 04:02:00 CST 2018 0 1917
10x Genomics RNA-seq 原理

下面的图来自文章 https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867415005498 Allon M. Klei ...

Wed Oct 27 06:44:00 CST 2021 0 1390
 
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