SUPPA 可变剪切分析
SUPPA是一款通过转录本定量来获取可变剪切定量结果的软件。转录本的定量方式有很多，例如count，FPKM, TPM等，作者建议使用TPM，因为先均一化了基因的长度，然后均一化了测序的深度。同时建议使用salmon软件进行定量 软件的下载与安装 首先下载salmon ...
原文：可变剪切 | isoform | PSI | 单细胞 | suppa
suppa 继续测试，这个软件真的非常好用，速度很快 文档清晰 使用方便。 suppa核心文件: https: github.com comprna SUPPA references SUPPA ref hg Homo sapiens.GRCh . .formatted.gtf ensembl hg .events.ioe 分析步骤小结： 用salmon快速比对，reference是转录本fast ...
2021-03-01 02:10 0 567 推荐指数：
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