在日常的科研中我们时不时的会听到小伙伴们在讨论那些关于测序的东西,什么高通量测序,二代测序,Sanger测序等等。今天我们就用最简单的言语来讲解一下这三种测序技术。 一代测序技术,也被称为Sanger测序,其实是由一个叫Sanger的人发明的一种测序方式。其利用了双脱氧核苷酸会终止PCR的原理 ...
三代测序 . 三代测序就是指单分子测序。 对于三代测序,存在多种定义。我们采用其中最简单易懂的那种。此种定义之下的三代测序技术,原本三足鼎立,不幸最早出现的Helicos早早谢幕,后来虽有科学家出大力进行挽救,也没有抢救成功,以致如今剩下Nanopore和PacBio双雄并峙。 三代测序的简要历史发展进程如下: 年,Helicos Bioscience公司推出世界上第一款单分子测序平台,名叫Hel ...
2020-09-21 18:09 0 809 推荐指数:
在日常的科研中我们时不时的会听到小伙伴们在讨论那些关于测序的东西,什么高通量测序,二代测序,Sanger测序等等。今天我们就用最简单的言语来讲解一下这三种测序技术。 一代测序技术,也被称为Sanger测序,其实是由一个叫Sanger的人发明的一种测序方式。其利用了双脱氧核苷酸会终止PCR的原理 ...
第三代测序技术是指单分子测序技术,在测序过程中不需要涉及PCR扩增,实现了对每一条DNA分子的单独测序。三代测序技术具有超长读长,还拥有不需要模板扩增、运行时间较短、直接检测表观修饰位点、较高的随机测序错误等特点。它弥补了第二代测序读长短、受GC含量影响大等局限性,已在小型基因组从头测序和组装中有 ...
一、测序原理 先介绍 Nanopore 测序中的几位主角: Reader :在自然界中,有一种可以嵌入到细胞膜中作为离子或分子通道的跨膜蛋白,具有天然的蛋白纳米孔。经过人为基因工程修饰后,得到的就是 Nanopore 测序所需的 Reader 蛋白。 Membrane:Reader 蛋白 ...
之前总结的有关Pacbio RSII测序数据QC的一些基本知识。 Part 1. 下机数据 用一个下机数据作为示例: 在analysis文件夹中,下机的数据被分割为三个文件进行存储,其中以bax.h5为后缀的是原始二进制文件;以subreads.fasta ...
“三代转录组”是什么?对于混迹在科研领域的一员,如果现在还不了解全长转录组测序,恐怕都不好意思说自己了解高通量测序了呢! 今天小编总结了一些三代全长转录组测序的相关问题,给大家来一个详细全面的解释,希望可以帮到爱学习的您哦! 1.什么是三代全长转录组测序 三代全长转录组测序,即利用 ...
这些三代全长转录组测序的相关问题,可以帮到爱学习的我哦 1.什么是三代全长转录组测序 三代全长转录组测序,即利用PacBio三代测序平台对某一物种的mRNA进行测序研究。它以平均超长读长10-15kb的优势、结合多片段文库筛选技术,实现了无需拼接的转录本分析,克服了传统二代转录 ...
基因组装配工具Falcon工作流程 1 Falcon简介Falcon (Fast Alignment and CONsensus),是由PacBio(太平洋生物科技公司)新开发的二倍体基因组从头拼接 ...
三代测序及基于三代数据的基因组组装流程评估 2018-04-04 12:13 名词解释 1D:ONT平台仅测一个DNA分子的一条链,测序通量比2D高但准确率低于2D序列。 2D:bi-directional reads即ONT平台测DNA分子的正负两链 ...