【怪毛匠子-整理】 awesome-single-cell List of software packages (and the people developing these methods) for single-cell data analysis, including RNA-seq ...
Current best practices in single cell RNA seq analysis: a tutorial 摘要 这篇文章主要阐述了一个典型的单细胞 RNA seq 分析的详细流程,包括了以下流程: pre processing 数据预处理 quality control 质量控制 normalization 数据标准化 data correction 数据修正 batc ...
2020-08-09 14:02 0 590 推荐指数:
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A survey of best practices for RNA-seq data analysis RNA-seq数据分析指南 内容 前言 各位同学/老师,大家好,现在由我给大家讲讲我的文献阅读报告! A survey of best practices ...
业界良心啊,开源的单细胞课程。 随便看了几章,课程写得非常用心,非常适合新手。 课程地址:Analysis of single cell RNA-seq data 源码地址:hemberg-lab/scRNA.seq.course ...
老生常谈的scRNASeq基本操作和原理: scrnaseq 的测序方法发展的年表: 在看一下列表: 分选单细胞的96孔板: 分析前的常规数据处理:FastQC、Trimming Reads、Demultiplexing(identify cell containing ...
什么是RNA-Seq (RNA Sequencing) 2011-07-14 ~ ADMIN 随着ome为词尾的各种组学的出现,转录组学已经成为了人们了解生物信息的一个重要组成部分。人们使用了许多办法来掌握转录组的情况,主要分为两类,一类是基于杂交,一类是基于下一代测序技术 ...
简单理解RNA-seq 刘小泽 已关注 2018.10.17 23:51* 字数 1518 阅读 46评论 0喜欢 3 今天就当一个小故事看吧,看了statQuest,感觉讲的很棒,于是分享给大家原版视频后台回复 ...
可变剪切的预测已经很流行了,目前主要有两个流派: 用DNA序列以及variant来预测可变剪切;GeneSplicer、MaxEntScan、dbscSNV、S-CAP、MMSplice、clinVar、spliceAI 用RNA来预测可变剪切;MISO、rMATS、DARTS ...
无生物学重复RNA-seq分析 CORNAS: coverage-dependent RNA-Seq analysis of gene expression data without biological replicates BMC Bioinformatics 的一篇文章中提出了一种新 ...