原文:BSA分析

目录 两种算法 . 欧氏距离 ED 算法 . SNP index算法 实操 . 上游分析 . 下游分析 两种算法 . 欧氏距离 ED 算法 mut与wt分别代表突变型混池 野生型混池,A C G T表示标记位点各突变型所占测序reads的比例,对于二倍体来说,大部分标记只有两种突变型。 MMAPPR,ED法是其中一个环节,通过计算不同混池间各突变型的频率距离,采用距离差异来反映标记与目标区域的连 ...

2020-05-13 15:38 0 1509 推荐指数:

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BSA混合分离分析

BSA(Bulked Segregant Analysis)又称混合群体分离分析法,是利用极端性状进行功能基因挖掘的一种方法。主要思想是将两个具有极端性状的群体进行混池测序,比较两个群体在多态位点(SNP)的Allele Frequency(AF)是否具有显著差异。以植物株高性状为例,收集株高处 ...

Thu Dec 31 00:15:00 CST 2015 0 2948
分析


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Thu Nov 05 01:37:00 CST 2015 14 93
势能分析(splay分析

定义 第$x$次操作后,势能为$\phi(x)$,该操作实际复杂度$c(x)$,均摊复杂度$a(x)$。 定义$a(x)=c(x)+\phi(x)-\phi(x-1)$。 那么总复杂度为$\ph ...

Mon May 27 00:02:00 CST 2019 0 577
采购分析&库存分析

采购分析 原材料采购是企业生产的基础,采购物品的价格以及质量问题直接影响到产品的质量与成本。一个好的全面的采购分析对于制定下一步采购策略是至关重要的。基于数据仓库技术的商业智能系统可实现供应商信用评价、业务员业绩考核等决策分析,帮助企业为顺利生产打下坚实的基础,为最终产品在质量和成本上的定位提供 ...

Tue Oct 13 00:26:00 CST 2020 0 631
二、硬件分析-电路分析

前言   本节介绍一些有关电路和电路分析的一些基本知识和工具。 电路的定义   由金属导线和电气、电子部件组成的导电回路,称为电路。在电路输入端加上电源使输入端产生电势差,电路连通时即可工作。电流的存在可以通过一些仪器测试出来,如电压表或电流表偏转、灯泡发光等;按照流过的电流性质,一般 ...

Thu Feb 14 21:17:00 CST 2019 0 662
数值分析-误差分析

方法误差与舍入误差 方法误差   在用数学模型去预测某个值的时候,由于选取的数学模型产生的误差   例如使用泰勒展开式求取近似f(x)时,其对应的拉格朗日余项即为方法误差 舍入误差   计 ...

Tue Oct 09 06:16:00 CST 2018 0 754
相关分析和回归分析

相关分析 相关分析定义 相关分析(correlation analysis),相关分析是研究现象之间是否存在某种依存关系,并对详细有依存关系的现象探讨其相关方向以及相关程度,是研究随机变量之间的相关关系的一种统计方法。 相关关系是一种非确定性的关系,比如,以X和Y分别记一个人 ...

Fri Apr 03 04:26:00 CST 2015 0 12581
lncRNA分析

目前人们对lncRNA认识还处在初级阶段,lncRNA起初被认为是基因组转录的“噪音”,是RNA聚合酶II转录的副产物,不具有生物学功能。然而大量研究表明,lncRNA在细胞核内、核外,通过染色 ...

Fri Jul 10 01:30:00 CST 2020 0 973
 
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