使用 FUMA 鉴定 Independent SNPs 和 Lead SNPs
一、Independent significant SNPs 和 Lead SNPs 定义 Independent significant SNPs： P 值小于 5e-8 的 SNP 位点，且 SNP 位点之间的 r2<0.6（注意，这里的 r2 指的是 LD 的 r2 值，不是相关性 ...
原文：SNPs & MAF
SNPs，全称是single nucleotide polymorphisms，SNPs等位基因频率的容易估计。采用混和样本估算等位基因的频率是种高效快速的策略。该策略的原理是：首先选择参考样本制作标准曲线，然后将待测的混和样本与标准曲线进行比较，根据所得信号的比例确定混和样本中各种等位基因的频率。 SNPs概念 在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。即：在不同个体的同一条染 ...
2013-11-24 16:09 0 4493 推荐指数：
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名词解释 | Lead SNPs | credible SNPs | Polygenicity | Discoverability
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