网页引物设计工具primer3的使用注意事项


在进行基因定位时,有时候需要扩增某个基因的全长,查看基因在两个极端池中的突变位点,以及判断基因是否为目的基因。此时,我们需要扩增出基因的全长

因此,需要在5’端UTR和3‘端UTR区域设计引物。

以甘蓝为例,在TO1000数据库网站(http://plants.ensembl.org/Brassica_oleracea/Info/Index)或者02-12数据库网站(http://brassicadb.cn/#/)下载该基因及其前后500bp序列

 TO1000:

BRAD(02-12)

 

 

 

 在Word文档中,用中括号[]将需要扩增的片段括起来,也就是在基因的          起始密码子前加上[             以及               终止密码子后加上] 

随后,将整段序列(包括5'和3’)复制,输入到Primer3的序列输入框中:

 

 

 

 

接着,设计引物的Tm值和引物长度:

 

 

 

但是,最最最最最最最最最最重要的是,忘了设计产物大小,如果产物大小没有设置正确,无论如何也不会设计出引物!!!!!!!笔者的血泪教训!!!

 


免责声明!

本站转载的文章为个人学习借鉴使用,本站对版权不负任何法律责任。如果侵犯了您的隐私权益,请联系本站邮箱yoyou2525@163.com删除。



 
粤ICP备18138465号  © 2018-2025 CODEPRJ.COM