1.背景
AlphaFold预测蛋白结构
2.github链接
https://github.com/Urinx/alphafold_pytorch
3.项目分析
alphafold.sh 运行alphaFold.py程序
4.结构
<1> replica副本 0 1 2 3 指什么?
<2> mode DBT是什么意思
D - Distogram, B - Background, T - Torsion
4.工具
blast:序列比对
hhblits:蛋白质序列比对工具
plmDCA:
附录:
一、名词解释:
distogram 概率直方图
二、指令:
1.for i in {a..d} done
linux的指令 for对变量进行循环赋值 done表示linux命令的结束
2.f'{protein.targets.domain_name}.distance'
f在字符串的引号前,表示对其规范化,可以引用变量
3.shell的命令直接使用 $可以提出变量的值
eg:a=15 echo $a
三、报错分析