biomod2 是做生态学使用的,该领域的应该都知道的,不知道的也不用安装的了,所以没有什么介绍的
1,windows下的在这里就不多介绍了,install.packages("biomod2"),该安装的都会依赖安装的没有什么好介绍的,下面主要介绍一下Linux安装
2,由于window运算变量太少,速度慢,下面我就来详细介绍一下Linux安装:
(a)系统版本,Centos 7,R 3.5.1
(b)install.packages("biomod2")安装不成功很正常的,看下面的截图

(c) 根据提示依次安装slam,tm,maxent这个没有障碍
(d)当这三个包都安装好了,请看下面截图

(e)提示xml2安装失败了,不要急这仅仅是个开始!
真正等着等着你的坑还在后面呢?哈哈哈
安装xml2却发现了,发现了,发现了新的问题?什么?又有问题了,对的,是,请看截图
安装好了 ,截图找不到了,不要担心我这里有记录,请看这里,提示是libicuicul8n.so找不到,这是神马?
这是个库,请find / -name "libicuicul8n.so" 找到后添加到环境变量,请看下面,请看这里:
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/path/to/it/
这样在安装xml2就ok 了,神马?你认为这么就完事了?
然后在安装xml2,biomod2应该是没有什么问题
(f)我处理的是tif文件,还需要安装rgdal ,不然安装好了biomod2也无法使用,
关于rgdal的安装请参看这里: http://bioinformatics-liuz.cn/2018/01/%E5%AE%89%E8%A3%85r%E5%8C%85rgdal/
要安装rgdal 需要安装proj和gdal这两个软件是处理图形的,上面坐着的那个链接讲的很详细了,我就不多说了,但是由于
系统的不同,软件版本的更新,有些问题作者遇见了,我没有遇见,我遇见了作者没有遇见

这个问题困扰了我很久,我以为是proj的问题,所以我卸载后又安装,安装又更新。。。。。循环往复的NNNN次,依然error ......
不要找下面出现错误的原因,要按上面来找,最后可以发现是库没有找到 。
ln -s /usr/local/lib/libproj.so.13 /usr/lib/libproj.so.13 把库加到lib下
最后把lib目录加载到环境变量中
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/lib:/usr/lib:/usr/lib64

到此,一切OK !
