seqtk 是一款针对fasta/fastq 文件进行处理的小程序，有很多的功能，速度很快，很方便；
源代码：https://github.com/lh3/seqtk
安装：
git clone https://github.com/lh3/seqtk
cd seqtk
make
测试：
seqtk seq : 用途：
1）将fastq 文件转换成fasta 文件
seqtk seq -A input.fastq > output.fasta
input.fastq的内容：
@NB001 ATGCACAAAACCCC + //////////////
output.fasta 的内容：
>NB001
ATGCACAAAACCCC
2）得到反向互补序列
seqtk seq -Ar input.fastq > output.fasta
output.fasta的内容为：
>NB001
GGGGTTTTGTGCAT
seqtk comp: 得到fastq/fasta 文件的碱基组成
seqtk comp input.fastq > out.txt
out.txt 的内容为：
NB001 14 6 6 1 1 0 0 0 0 0 0 0
第一列为序列的name; 第二列为长度，3-6列代表在该序列中A, C, G ,T 4中碱基的数目
用这个程序可以快速得到每条序列的长度