解决办法：
只能通过一些trick来减小生成的中间矩阵的大小。比如我所遇到的问题是：
我要运行(W%*%H%*%t(H)) 这句话，（W的规模是5000000*10，而H的规模是10*100000）
解释执行W%*%H的时候报错：不能有负长度矢量。
坑爹的中文报错，google发现，和中文有关的R文档、记录真是少得可怜，终于通过英文“negative length vectors are not allowed”这句话，
看到老外们的解释，才知道了，简而言之就是因为数据规模太大，而R系统不允许生成生成数据规模超过2^31的结果。
改成(W%*%(H%*%t(H)))后，问题就解决了。。。