bam文件softclip ， hardclip ，markduplicate的探究

  測序產生的bam文件，有一些reads在cigar值里顯示存在softclip，有一些存在hardclip，究竟softclip和hardclip是怎么判斷出來的，還有是怎么標記duplicate的reads的，我懷着這些問題進行了探究。 測試步驟 編輯兩個bed文件，分別含有 ...