R語言數據分析利器data.table包 —— 數據框結構處理精講
版權聲明：本文為博主原創文章，轉載請注明出處 R語言data.table包是自帶包data.frame的升級版，用於數據框格式數據的處理，最大的特點快。包括兩個方面，一方面是寫的快，代碼簡潔，只要一行命令就可以完成諸多任務，另一方面是處理快，內部處理的步驟進行了程序上的優化 ...
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R語言data.table包fread讀取數據
R語言處理大規模數據速度不算快，通過安裝其他包比如data.table可以提升讀取處理速度。 案例，分別用read.csv和data.table包的fread函數讀取一個1.67萬行、230列的表格數據。 參考資料： R語言data.table速查（博客園 ...
R語言基因組數據分析可能會用到的data.table函數整理
版權聲明：本文為博主原創文章，轉載請注明出處 R語言data.table包是自帶包data.frame的升級版，用於數據框格式數據的處理，最大的特點快。包括兩個方面，一方面是寫的快，代碼簡潔，只要一行命令就可以完成諸多任務，另一方面是處理快，內部處理的步驟進行了程序上 ...
將基因組數據分類並寫出文件，python，awk，R data.table速度PK
由於基因組數據過大，想進一步用R語言處理擔心系統內存不夠，因此想着將文件按染色體拆分，發現python，awk，R 語言都能夠非常簡單快捷的實現，那么速度是否有差距呢，因此在跑幾個50G的大文 ...